More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2907 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 338 aa  677    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  93.2 
 
 		 353 aa  632  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  61.83 
 
 		 337 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  56.12 
 
 		 333 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  46.75 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  38.21 
 
 		 386 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  38.51 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  37.46 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 		 325 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  37.68 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  38.58 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.38 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.22 
 
 		 231 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  36.5 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.23 
 
 		 231 aa  176  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.23 
 
 		 231 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  36.58 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.12 
 
 		 231 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  36.42 
 
 		 327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  41.37 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.99 
 
 		 231 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.18 
 
 		 231 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.19 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.83 
 
 		 237 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.44 
 
 		 239 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.8 
 
 		 230 aa  143  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.17 
 
 		 236 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.17 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 		 331 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.17 
 
 		 232 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  38.65 
 
 		 225 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.32 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 288 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 		 287 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  27.36 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  35.48 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  27.36 
 
 		 288 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  34.89 
 
 		 282 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  36.99 
 
 		 554 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  26.41 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 282 aa  99.8  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 		 283 aa  99.4  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  28.09 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 		 281 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 		 283 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 324 aa  97.1  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  29.1 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 		 294 aa  96.7  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  29.1 
 
 		 299 aa  96.3  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1101  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  34.29 
 
 		 216 aa  95.9  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.449709  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  31.27 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.78 
 
 		 228 aa  95.1  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  33.23 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2356  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.06 
 
 		 222 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000440945  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  35.18 
 
 		 291 aa  94  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.48 
 
 		 282 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 281 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 299 aa  93.6  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  28.94 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 		 285 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  27.01 
 
 		 281 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>