More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5794 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
230 aa  460  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  83.98 
 
 
231 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  82.68 
 
 
231 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  81.39 
 
 
231 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  72.51 
 
 
231 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  66.67 
 
 
231 aa  311  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  72.04 
 
 
231 aa  311  6.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  66.38 
 
 
230 aa  304  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  59.72 
 
 
325 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 
325 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 
325 aa  248  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
325 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  60.1 
 
 
325 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  60 
 
 
327 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  58.15 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  59.62 
 
 
325 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  58.53 
 
 
325 aa  240  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 
330 aa  238  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  59.02 
 
 
344 aa  237  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  56.22 
 
 
325 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 
325 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  53.36 
 
 
325 aa  232  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  54.63 
 
 
324 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.13 
 
 
237 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.43 
 
 
230 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.76 
 
 
232 aa  198  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.95 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.7 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.7 
 
 
236 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.76 
 
 
225 aa  191  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
331 aa  168  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 
333 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  43.19 
 
 
338 aa  154  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  43.19 
 
 
353 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  36.53 
 
 
338 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  42.92 
 
 
337 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  35.24 
 
 
386 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 
289 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
288 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
288 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
306 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
288 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
300 aa  99  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 
300 aa  95.9  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
285 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.29 
 
 
294 aa  92.4  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0550  ATP phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.775439  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
286 aa  89  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 
285 aa  89  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.98 
 
 
282 aa  88.2  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
282 aa  87  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.5 
 
 
293 aa  87  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
294 aa  86.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 
286 aa  85.9  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5474  ATP phosphoribosyltransferase  33.51 
 
 
231 aa  85.5  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 
282 aa  85.1  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2356  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.26 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000440945  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
290 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
299 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
283 aa  83.6  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  31.08 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
299 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
299 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
289 aa  82  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  32.95 
 
 
295 aa  81.6  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
299 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
283 aa  81.6  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
299 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5526  ATP phosphoribosyltransferase  31.84 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.58 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2786  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  28.88 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.92 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  33.98 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.47 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1491  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.74 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0152301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>