More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0578 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  100 
 
 		 338 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 		 333 aa  339  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  46.76 
 
 		 353 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 		 338 aa  303  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  47.46 
 
 		 337 aa  292  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  35.8 
 
 		 386 aa  239  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.18 
 
 		 231 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43 
 
 		 231 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.48 
 
 		 231 aa  164  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 325 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 325 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.69 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.53 
 
 		 230 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.62 
 
 		 231 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.62 
 
 		 231 aa  146  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  37.86 
 
 		 231 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 285 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 		 284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.45 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.27 
 
 		 230 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.45 
 
 		 288 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 324 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  27.49 
 
 		 330 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.84 
 
 		 237 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  37.68 
 
 		 232 aa  132  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 293 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  37.5 
 
 		 239 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.62 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.36 
 
 		 236 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.36 
 
 		 236 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  28.79 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  32.1 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 295 aa  108  9.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 284 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  27.69 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.62 
 
 		 225 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.62 
 
 		 282 aa  106  6e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  27.55 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.84 
 
 		 228 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  27.55 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  31.45 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 290 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 293 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  27.38 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  28.62 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  27.24 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>