More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2637 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
296 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  66.78 
 
 
294 aa  385  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  66.78 
 
 
282 aa  385  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  67.12 
 
 
282 aa  384  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  66.55 
 
 
284 aa  384  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  52.36 
 
 
284 aa  293  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 
289 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 
286 aa  271  1e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  49.16 
 
 
285 aa  267  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  48.99 
 
 
300 aa  263  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  42.62 
 
 
288 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 
293 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  42.28 
 
 
288 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  46.8 
 
 
300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
306 aa  253  3e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
288 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 
288 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  38.8 
 
 
292 aa  195  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
283 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 
285 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.32 
 
 
284 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  37.25 
 
 
294 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
282 aa  175  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
294 aa  172  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  31.31 
 
 
295 aa  170  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
299 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 
297 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
294 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  34.11 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
304 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  31.31 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  34.87 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  36.79 
 
 
289 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  29.97 
 
 
287 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
298 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  31 
 
 
299 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
300 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
285 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
294 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
294 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 
310 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
299 aa  159  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
286 aa  159  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 
299 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
299 aa  159  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  33.77 
 
 
299 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 
299 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
299 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
299 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
283 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  34.86 
 
 
338 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
299 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
299 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
299 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 
299 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  32 
 
 
293 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
299 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
290 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
299 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 
299 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
293 aa  152  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  32 
 
 
299 aa  150  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
298 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 
299 aa  150  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  30.79 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
299 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 
281 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
304 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 
284 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
289 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
299 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  33.86 
 
 
333 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
291 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
281 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
299 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  35.35 
 
 
287 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  32.44 
 
 
304 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>