More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0466 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  93.94 
 
 
231 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  82.68 
 
 
231 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  81.39 
 
 
230 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  68.4 
 
 
231 aa  316  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  69.43 
 
 
230 aa  316  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  67.97 
 
 
231 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  70.14 
 
 
231 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  57.21 
 
 
325 aa  248  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  59.42 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 
325 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 
325 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  56.33 
 
 
325 aa  241  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  58.65 
 
 
325 aa  241  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  58.1 
 
 
325 aa  240  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  55.56 
 
 
327 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  56.87 
 
 
330 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  58.54 
 
 
344 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  58.17 
 
 
325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
325 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
325 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  55.98 
 
 
325 aa  228  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  56.16 
 
 
325 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  58.05 
 
 
324 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 
325 aa  224  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.39 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.14 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.19 
 
 
239 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.1 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.34 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.34 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.89 
 
 
225 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 
333 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
338 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  42.18 
 
 
353 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.62 
 
 
338 aa  146  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  33.81 
 
 
386 aa  119  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 
288 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 
289 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
306 aa  102  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
300 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 
288 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.38 
 
 
284 aa  98.6  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  34.45 
 
 
288 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  33.97 
 
 
288 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
285 aa  92.4  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
300 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0550  ATP phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
210 aa  90.5  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.775439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5474  ATP phosphoribosyltransferase  34.05 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
284 aa  89  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
282 aa  88.6  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
293 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  32.11 
 
 
295 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
294 aa  87.8  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 
285 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  31.22 
 
 
285 aa  87  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
286 aa  85.1  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3388  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.47 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.77 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  31.48 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  31.25 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.69 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1964  ATP phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1637  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.25 
 
 
202 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0830  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  28.81 
 
 
214 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81865  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2919  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.61 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.82 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 
296 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1769  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.46 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2881  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.57 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2174  ATP phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  32.83 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0695  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.85 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5526  ATP phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1586  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.74 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0087708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4452  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.121483  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2407  ATP phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.155904  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 
299 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 
283 aa  75.1  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 
290 aa  75.1  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  29 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  29 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0502  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.82 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1023  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.65 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  29 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0803  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.85 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  31.7 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  27.9 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1205  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.16 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>