More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1769 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1769  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
217 aa  447  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.62 
 
 
225 aa  254  9e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2356  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.13 
 
 
222 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000440945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1491  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  53.67 
 
 
223 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0152301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  52.94 
 
 
228 aa  240  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4058  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3043  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.42 
 
 
212 aa  208  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00016685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0819  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.89 
 
 
213 aa  207  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0887901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0383  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.56 
 
 
212 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.85 
 
 
219 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3101  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.56 
 
 
212 aa  205  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3706  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.39 
 
 
212 aa  203  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3801  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.39 
 
 
212 aa  203  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02190  ATP phosphoribosyltransferase  46.45 
 
 
223 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0242064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2001  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.67 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.911553  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.53 
 
 
213 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0381  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.13 
 
 
214 aa  192  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2881  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.41 
 
 
213 aa  191  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2980  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.04 
 
 
206 aa  188  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3157  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.51 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1101  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  43.75 
 
 
216 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.449709  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0502  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.23 
 
 
223 aa  175  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0924  ATP phosphoribosyltransferase  41.75 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00452577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2786  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.18 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1327  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.46 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
554 aa  171  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1479  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.44 
 
 
209 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3886  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.49 
 
 
211 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2407  ATP phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 
214 aa  169  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.155904  normal  0.103164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1525  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40 
 
 
211 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0550  ATP phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
210 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.775439  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3040  ATP phosphoribosyltransferase  45.02 
 
 
215 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0812933  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2649  ATP phosphoribosyltransferase  45.02 
 
 
215 aa  168  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1316  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.51 
 
 
211 aa  167  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1290  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.51 
 
 
211 aa  167  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1425  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.51 
 
 
211 aa  167  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1458  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.49 
 
 
211 aa  167  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1496  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.02 
 
 
211 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1564  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.51 
 
 
211 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1289  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.02 
 
 
211 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1964  ATP phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 
206 aa  167  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1128  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.2 
 
 
210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2174  ATP phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1903  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.75 
 
 
231 aa  162  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000125958  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.36 
 
 
212 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3388  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.38 
 
 
214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2193  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.75 
 
 
231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000274896  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0106  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.84 
 
 
208 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.940502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2994  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.72 
 
 
218 aa  161  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0830  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.87 
 
 
214 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81865  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4439  ATP phosphoribosyltransferase  43.69 
 
 
211 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309969  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4134  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  43.69 
 
 
211 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333994  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0803  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.29 
 
 
233 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0380  ATP phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 
216 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.162364  normal  0.273387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3561  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 
232 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.399643  hitchhiker  0.0000178128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0870  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.72 
 
 
211 aa  158  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.144318  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0632  ATP phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 
204 aa  158  5e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0397  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.44 
 
 
232 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0351  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.44 
 
 
217 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0342  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.44 
 
 
217 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2683  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.44 
 
 
217 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0424  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.44 
 
 
217 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2113  ATP phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 
214 aa  157  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0327  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.62 
 
 
217 aa  157  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2715  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 
218 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3694  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 
218 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2766  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 
218 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3725  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 
218 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3667  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 
218 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1787  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 
218 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0883  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.58 
 
 
211 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332563  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3238  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.25 
 
 
218 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.297185  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1890  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.95 
 
 
216 aa  156  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3522  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.62 
 
 
217 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.157646 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0403  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.62 
 
 
217 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2764  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.26 
 
 
211 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216973  hitchhiker  0.00563618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2760  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.81 
 
 
232 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5526  ATP phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 
216 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3353  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.26 
 
 
211 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2702  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.02 
 
 
214 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.805897  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4346  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.55 
 
 
218 aa  155  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0988  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.55 
 
 
208 aa  156  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1023  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.44 
 
 
222 aa  156  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0726  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.76 
 
 
216 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0695  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.41 
 
 
217 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0759  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.76 
 
 
216 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.0720902 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3496  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.79 
 
 
215 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.780493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1586  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  39.9 
 
 
214 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0087708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4250  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.43 
 
 
211 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0972  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.43 
 
 
211 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5072  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.15 
 
 
215 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.746363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.89 
 
 
213 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2777  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.19 
 
 
221 aa  153  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0752038  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0105  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  41.87 
 
 
208 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.951142 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2454  ATP phosphoribosyltransferase  41.26 
 
 
214 aa  153  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1964  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.38 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.952274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3169  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.66 
 
 
213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.992419  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3532  ATP phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 
212 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242317  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12920  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  42.79 
 
 
211 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0782  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  40.38 
 
 
220 aa  152  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>