More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1118 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  64.11 
 
 		 290 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  62.72 
 
 		 293 aa  388  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  58.42 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  67.82 
 
 		 293 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  58.08 
 
 		 291 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  57.73 
 
 		 291 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  61.94 
 
 		 293 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  57.39 
 
 		 291 aa  364  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  56.7 
 
 		 291 aa  363  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  57.84 
 
 		 290 aa  363  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  57.49 
 
 		 290 aa  362  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  63.41 
 
 		 293 aa  353  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  61.38 
 
 		 294 aa  348  6e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  53.95 
 
 		 310 aa  338  7e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  58.28 
 
 		 297 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 293 aa  334  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  54.39 
 
 		 286 aa  323  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 		 294 aa  322  3e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  53.31 
 
 		 289 aa  321  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 291 aa  319  3.9999999999999996e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 294 aa  318  6e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 297 aa  318  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 294 aa  317  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  55.4 
 
 		 289 aa  317  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  51.89 
 
 		 294 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  53.12 
 
 		 292 aa  316  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 291 aa  315  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 294 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  56.45 
 
 		 290 aa  311  9e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 289 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 		 291 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  43.64 
 
 		 291 aa  218  6e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 		 290 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  40.89 
 
 		 291 aa  212  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 		 325 aa  168  8e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 286 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  27.72 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  27.02 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 292 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  26.46 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  27.09 
 
 		 307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  26.15 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  27.3 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  29.02 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  27.3 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 294 aa  109  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  30.28 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  25.96 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  25.53 
 
 		 285 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  27.37 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  24.41 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  27.87 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  26.41 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  23.53 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  28.8 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  26.37 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  25.18 
 
 		 281 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  26.41 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  26.41 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  26.5 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  25.52 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  28.14 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>