More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1107 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 		 297 aa  360  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  59.65 
 
 		 286 aa  353  2.9999999999999997e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 		 292 aa  351  8.999999999999999e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 		 294 aa  347  1e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 		 294 aa  346  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  56.75 
 
 		 294 aa  346  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  56.6 
 
 		 310 aa  347  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 		 294 aa  346  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  55.17 
 
 		 294 aa  341  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 		 289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 		 291 aa  323  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 290 aa  317  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 		 289 aa  316  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 		 291 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  51.55 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  52.58 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 		 289 aa  310  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  53.82 
 
 		 290 aa  309  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 291 aa  308  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 291 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  50.52 
 
 		 293 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  50.17 
 
 		 291 aa  305  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  50.17 
 
 		 290 aa  300  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  49.83 
 
 		 290 aa  299  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  47.44 
 
 		 293 aa  278  6e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 293 aa  278  9e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  48.08 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 		 291 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  43.94 
 
 		 291 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  39.93 
 
 		 290 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  39.24 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  39.93 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  39.93 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  37.46 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 		 289 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 		 288 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 282 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 284 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 284 aa  138  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 281 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27.34 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  29.29 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.87 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  30.31 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  28.96 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>