More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0360 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  75.42 
 
 		 294 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  74.14 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  72.01 
 
 		 293 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  62.98 
 
 		 293 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  61.94 
 
 		 290 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  65.52 
 
 		 293 aa  362  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  58.28 
 
 		 291 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  55.36 
 
 		 290 aa  334  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  55.52 
 
 		 291 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 		 291 aa  328  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  55.17 
 
 		 291 aa  325  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  55.17 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  54.48 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 		 293 aa  316  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  53.45 
 
 		 297 aa  308  8e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 		 310 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 		 286 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 		 292 aa  299  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  51.38 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  50.69 
 
 		 294 aa  295  7e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  50.17 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  49.32 
 
 		 294 aa  289  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  49.13 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 		 289 aa  285  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  51.56 
 
 		 289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  53.63 
 
 		 290 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  49.31 
 
 		 291 aa  281  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  46.08 
 
 		 291 aa  244  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  45.21 
 
 		 290 aa  242  6e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  46.42 
 
 		 291 aa  229  5e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  43.15 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  42.12 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 284 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 292 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 284 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 		 284 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 285 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 281 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 287 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 286 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.91 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  30.9 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 283 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 		 282 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  32.94 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 287 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 283 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  30.31 
 
 		 299 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  29.9 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>