More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3682 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  60.14 
 
 
291 aa  355  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 
310 aa  347  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 
294 aa  323  3e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
297 aa  321  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  54.2 
 
 
294 aa  322  7e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
294 aa  322  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  54.2 
 
 
294 aa  321  9.000000000000001e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
292 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
294 aa  318  5e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
291 aa  310  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  52.08 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  52.82 
 
 
286 aa  300  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
290 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  52.43 
 
 
289 aa  294  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
293 aa  292  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  50.69 
 
 
290 aa  291  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
291 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
291 aa  289  4e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  52.26 
 
 
293 aa  286  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  50.17 
 
 
291 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
294 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  50.52 
 
 
291 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
297 aa  279  5e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  50.52 
 
 
293 aa  278  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  48.78 
 
 
291 aa  278  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 
290 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  48.62 
 
 
293 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  48.26 
 
 
290 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
293 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
291 aa  269  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
291 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  40.28 
 
 
290 aa  227  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
291 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  38.19 
 
 
290 aa  215  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  43.94 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  39.79 
 
 
290 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
325 aa  194  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  37.8 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 
286 aa  170  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  37.24 
 
 
285 aa  169  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 
306 aa  168  9e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 
284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.86 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  36.79 
 
 
296 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
300 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
294 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
282 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
282 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
292 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
288 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
288 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
288 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
283 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
286 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
285 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
282 aa  124  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.27 
 
 
286 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
286 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  26.64 
 
 
285 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
286 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
284 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  31.68 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
284 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
294 aa  120  3e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 
283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  27.84 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 
299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  115  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  28.57 
 
 
299 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
281 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
299 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
298 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
299 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  29.89 
 
 
283 aa  113  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
282 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>