More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2945 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
291 aa  590  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  85.57 
 
 
291 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  83.51 
 
 
291 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  81.1 
 
 
291 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  81.53 
 
 
290 aa  494  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  81.53 
 
 
290 aa  494  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  78.69 
 
 
291 aa  485  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  60.63 
 
 
293 aa  374  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  59.93 
 
 
290 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  61.25 
 
 
293 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  57.39 
 
 
291 aa  353  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  58.97 
 
 
293 aa  351  7e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  56.49 
 
 
286 aa  335  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  55.33 
 
 
310 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
289 aa  328  6e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
294 aa  326  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
297 aa  323  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 
292 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  55.52 
 
 
294 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
291 aa  322  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
294 aa  321  8e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  52.92 
 
 
294 aa  321  9.000000000000001e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  52.04 
 
 
294 aa  319  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  52.58 
 
 
294 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  55.52 
 
 
297 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  56.45 
 
 
293 aa  318  5e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
291 aa  308  5e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  51.22 
 
 
289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  51.92 
 
 
290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 
293 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  48.96 
 
 
289 aa  269  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
290 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
290 aa  229  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  43.99 
 
 
291 aa  229  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
290 aa  225  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  40.34 
 
 
290 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  41.58 
 
 
291 aa  218  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 
291 aa  211  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  32.27 
 
 
325 aa  162  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
285 aa  153  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 
288 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
306 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 
284 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
286 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
300 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
288 aa  136  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 
286 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
282 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
300 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
284 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 
281 aa  122  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
293 aa  122  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  27.37 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  27.72 
 
 
284 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  26.41 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
288 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 
281 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  27.21 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  27.02 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 
281 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
280 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  25.78 
 
 
281 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  26.76 
 
 
296 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  27.92 
 
 
295 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  27.02 
 
 
283 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
298 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  26.15 
 
 
282 aa  105  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
298 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
282 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  28.27 
 
 
294 aa  103  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
282 aa  103  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 
285 aa  103  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  25.44 
 
 
283 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  25.7 
 
 
285 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27 
 
 
285 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 
284 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  27.05 
 
 
288 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  27.8 
 
 
285 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  25.53 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  26.03 
 
 
286 aa  99.4  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
281 aa  99.4  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 
282 aa  99.4  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  23.59 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  27.18 
 
 
286 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0889  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.08 
 
 
209 aa  97.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.539518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>