More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1270 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  76.29 
 
 
291 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  60 
 
 
291 aa  351  8e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
290 aa  301  9e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  50.69 
 
 
290 aa  290  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
290 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  49.83 
 
 
289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  52.25 
 
 
290 aa  265  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 
294 aa  263  4e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 
294 aa  260  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
294 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
294 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
289 aa  254  9e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
294 aa  251  1e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  48.11 
 
 
293 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 
310 aa  248  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  46.34 
 
 
286 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  45.8 
 
 
293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  42.96 
 
 
291 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  46.05 
 
 
294 aa  232  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  42.96 
 
 
291 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  43.94 
 
 
291 aa  230  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 
291 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
291 aa  227  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
293 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
289 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  43.69 
 
 
293 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 
297 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  40.69 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  40.69 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  42.96 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  41.58 
 
 
291 aa  218  6e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  43.64 
 
 
293 aa  214  9e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  40.89 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
325 aa  186  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 
285 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  40.21 
 
 
300 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 
286 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
300 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  38.44 
 
 
284 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 
284 aa  161  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  34.24 
 
 
288 aa  158  8e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  38.81 
 
 
282 aa  158  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  34.24 
 
 
288 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  37.25 
 
 
294 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  38.52 
 
 
283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
288 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  37.54 
 
 
282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  37.12 
 
 
289 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
294 aa  148  8e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
306 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
285 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
282 aa  143  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
282 aa  142  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  32.32 
 
 
286 aa  132  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  33.22 
 
 
295 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
286 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 
287 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
285 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
296 aa  115  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
280 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
288 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  31.13 
 
 
307 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
282 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
292 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
288 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
281 aa  106  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
282 aa  106  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
283 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
283 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 
283 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
295 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
284 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
284 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
282 aa  103  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
281 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
283 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
283 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 
294 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 
281 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
299 aa  102  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  30.29 
 
 
284 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
299 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 
281 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
299 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1708  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.52 
 
 
208 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>