More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2979 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  71.53 
 
 
287 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  69.04 
 
 
281 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  68.33 
 
 
281 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  67.61 
 
 
284 aa  384  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  68.33 
 
 
281 aa  387  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  68.44 
 
 
288 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  68.9 
 
 
283 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  68.9 
 
 
283 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  68.9 
 
 
283 aa  383  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  58.16 
 
 
282 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  57.75 
 
 
284 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 
283 aa  322  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 
286 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  58.01 
 
 
284 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  58.36 
 
 
280 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
281 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 
282 aa  315  5e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  55.16 
 
 
281 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  56.07 
 
 
285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  55.21 
 
 
288 aa  311  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 
282 aa  311  9e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  55.32 
 
 
294 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 
281 aa  308  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  56.23 
 
 
284 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  54.26 
 
 
282 aa  303  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  53.68 
 
 
285 aa  303  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  52.98 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  53.52 
 
 
287 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  54.09 
 
 
281 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 
287 aa  295  5e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 
283 aa  277  2e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  52.65 
 
 
282 aa  276  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  37.32 
 
 
295 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  35.64 
 
 
286 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  34.56 
 
 
307 aa  154  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 
292 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
285 aa  149  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
287 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
283 aa  143  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  32.54 
 
 
304 aa  142  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  34.88 
 
 
282 aa  139  7e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
286 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 
293 aa  136  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
300 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  34.04 
 
 
294 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  36.24 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 
288 aa  133  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
305 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
288 aa  132  9e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 
288 aa  130  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
285 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 
284 aa  126  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 
288 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
306 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
282 aa  122  6e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
298 aa  122  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
298 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
299 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 
292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.79 
 
 
225 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
299 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.45 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  36.28 
 
 
303 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 
299 aa  113  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
294 aa  112  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
290 aa  112  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 
299 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  29.97 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  37.31 
 
 
228 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
291 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
293 aa  109  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>