More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2357 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
294 aa  593  1e-168  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  91.16 
 
 
294 aa  549  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  91.67 
 
 
292 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  88.78 
 
 
294 aa  536  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  88.44 
 
 
294 aa  533  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  87.93 
 
 
297 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  85.71 
 
 
294 aa  517  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  67.7 
 
 
310 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  59.79 
 
 
291 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  60.14 
 
 
289 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  58.74 
 
 
289 aa  353  2e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  59.51 
 
 
286 aa  353  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 
291 aa  346  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  59.44 
 
 
290 aa  342  5e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
290 aa  338  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  53.95 
 
 
291 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 
291 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  52.58 
 
 
291 aa  329  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  52.58 
 
 
291 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  53.31 
 
 
290 aa  326  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  52.96 
 
 
290 aa  324  9e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  54.55 
 
 
289 aa  322  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  52.92 
 
 
291 aa  321  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  52.61 
 
 
293 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 
293 aa  309  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  54.14 
 
 
293 aa  301  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  52.23 
 
 
291 aa  300  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  51.03 
 
 
293 aa  291  7e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
294 aa  289  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  49.32 
 
 
297 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  47.06 
 
 
293 aa  278  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
291 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  47.77 
 
 
291 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 
291 aa  233  3e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 
290 aa  231  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
290 aa  229  5e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 
290 aa  226  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 
285 aa  189  7e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  37.59 
 
 
300 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 
325 aa  177  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.74 
 
 
282 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  36.68 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
289 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  38.28 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
293 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
288 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
284 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
288 aa  159  4e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
284 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  36.45 
 
 
296 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
288 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
292 aa  148  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
285 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
286 aa  140  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 
282 aa  138  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
282 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
283 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
284 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
283 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
287 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
294 aa  125  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 
284 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 
285 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
287 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
294 aa  123  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
280 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  26.3 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
283 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
287 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.23 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  28.12 
 
 
282 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 
284 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
281 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
283 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
283 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  30.1 
 
 
295 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
282 aa  112  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
281 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 
299 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
282 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>