More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1963 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 293 aa  589  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  87.37 
 
 		 293 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  82.07 
 
 		 294 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  71.67 
 
 		 293 aa  443  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  74.14 
 
 		 297 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  73.04 
 
 		 293 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  63.76 
 
 		 290 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  61.94 
 
 		 291 aa  354  7.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  58.97 
 
 		 291 aa  351  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 		 291 aa  349  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  57.49 
 
 		 290 aa  348  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  57.49 
 
 		 290 aa  348  7e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  57.93 
 
 		 291 aa  348  9e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  56.31 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  55.52 
 
 		 291 aa  334  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  56.84 
 
 		 286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  54.64 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  54.3 
 
 		 292 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 		 310 aa  318  9e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  55.05 
 
 		 289 aa  316  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  54.45 
 
 		 293 aa  314  9e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  54.36 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  52.4 
 
 		 294 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  52.74 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 		 294 aa  311  5.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  52.4 
 
 		 294 aa  311  5.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  53.29 
 
 		 294 aa  309  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  51.03 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  54.36 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  52.26 
 
 		 289 aa  286  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 		 291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  48.11 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  47.08 
 
 		 291 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  45.36 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  41.84 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 325 aa  169  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 293 aa  149  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  31.83 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  34.14 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 284 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 282 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 		 283 aa  112  9e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 		 281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  30.58 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.08 
 
 		 284 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  26.74 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 		 283 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>