More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1680 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 286 aa  567  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  95.45 
 
 		 284 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  70.38 
 
 		 282 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  70.03 
 
 		 282 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  67.02 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  68.06 
 
 		 282 aa  389  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  67.25 
 
 		 282 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  65.73 
 
 		 284 aa  381  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  67.13 
 
 		 280 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  63.99 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  63.99 
 
 		 284 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  61.89 
 
 		 281 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  65.16 
 
 		 282 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  61.89 
 
 		 281 aa  359  4e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  62.37 
 
 		 287 aa  358  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  61.09 
 
 		 288 aa  355  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  62.24 
 
 		 285 aa  355  5.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  59.79 
 
 		 282 aa  350  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  60.28 
 
 		 283 aa  347  9e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 		 287 aa  346  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  59.09 
 
 		 294 aa  338  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  58.89 
 
 		 283 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  61.64 
 
 		 287 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 		 281 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  59.79 
 
 		 287 aa  332  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 		 281 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 		 281 aa  322  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 		 284 aa  322  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 		 281 aa  320  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 		 288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  55.59 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  55.59 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  55.59 
 
 		 283 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  39.73 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  36.54 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  35.53 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  36.91 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  36.33 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 		 286 aa  148  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 295 aa  139  7.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  43.46 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 299 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 293 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 		 294 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  34.81 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 299 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  30.31 
 
 		 300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 		 289 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 299 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 332 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 288 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>