More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0160 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
294 aa  584  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  84.04 
 
 
282 aa  485  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  81.21 
 
 
282 aa  481  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  82.62 
 
 
282 aa  474  1e-133  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  49.82 
 
 
286 aa  291  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  50.7 
 
 
285 aa  288  7e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  39.36 
 
 
300 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  38.08 
 
 
286 aa  185  6e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  37.23 
 
 
282 aa  185  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  38.03 
 
 
284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  40.91 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  39.01 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 
289 aa  183  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  37.33 
 
 
294 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  37.01 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  39.93 
 
 
292 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
300 aa  176  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 
282 aa  176  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
306 aa  172  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 
288 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
288 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
290 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 
285 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  32.38 
 
 
284 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
291 aa  148  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  36.01 
 
 
284 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 
295 aa  145  6e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
286 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  34.35 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 
284 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  34.78 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 
285 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 
281 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
283 aa  139  6e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
283 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 
281 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  33.22 
 
 
295 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 
298 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
291 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
281 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
287 aa  136  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
286 aa  135  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 
294 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 
281 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.67 
 
 
294 aa  134  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
299 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
287 aa  132  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 
289 aa  130  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
283 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
283 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
283 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
292 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
299 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02190  ATP phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 
223 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0242064  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 
299 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
288 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
290 aa  126  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
294 aa  126  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
299 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
299 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
299 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
299 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
331 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
298 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
294 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
290 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
298 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
294 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
299 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
299 aa  124  2e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
293 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
299 aa  124  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
299 aa  123  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 
297 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 
298 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 
332 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>