More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1052 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 310 aa  619  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  68.38 
 
 		 294 aa  421  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  68.04 
 
 		 294 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  67.93 
 
 		 297 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  67.01 
 
 		 294 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  67.01 
 
 		 294 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  67.13 
 
 		 292 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  67.7 
 
 		 294 aa  413  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  64.36 
 
 		 289 aa  384  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  59.17 
 
 		 289 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  57.93 
 
 		 291 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  57.79 
 
 		 290 aa  354  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  59.52 
 
 		 290 aa  350  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  59.44 
 
 		 286 aa  349  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 		 289 aa  347  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  56.6 
 
 		 291 aa  347  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  56.06 
 
 		 293 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  56.9 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 		 291 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  56.36 
 
 		 291 aa  335  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  53.95 
 
 		 291 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  55.33 
 
 		 291 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  54.67 
 
 		 290 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 290 aa  325  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  53.95 
 
 		 291 aa  325  7e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 		 293 aa  318  9e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  54.98 
 
 		 293 aa  308  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  53.08 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  53.26 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  53.42 
 
 		 297 aa  295  5e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  46.74 
 
 		 293 aa  293  4e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  44.86 
 
 		 290 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 		 290 aa  249  4e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 		 291 aa  248  6e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  45.39 
 
 		 291 aa  237  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 		 290 aa  235  9e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  39.86 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 288 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  36.12 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 284 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 286 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  31.27 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  31.1 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 282 aa  123  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  28.18 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  29.12 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  29.1 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  29.1 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 285 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>