More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2370 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  78.89 
 
 
290 aa  478  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  75.52 
 
 
290 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  62.98 
 
 
290 aa  351  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
291 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  52.07 
 
 
291 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 
291 aa  287  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  46.18 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  47.92 
 
 
290 aa  251  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
286 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 
289 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 
290 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
293 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 
310 aa  235  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  42.56 
 
 
294 aa  234  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
294 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
293 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  43 
 
 
294 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  40.69 
 
 
291 aa  229  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  42.21 
 
 
292 aa  228  7e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 
294 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  41.87 
 
 
294 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  39.93 
 
 
291 aa  225  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
291 aa  225  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  40.14 
 
 
297 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  42.12 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  38.97 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
294 aa  219  5e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  39.1 
 
 
290 aa  216  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  38.62 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  42.12 
 
 
297 aa  215  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  38.75 
 
 
290 aa  215  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  39.79 
 
 
289 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  39.31 
 
 
291 aa  207  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  39.25 
 
 
293 aa  205  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 
293 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  36.33 
 
 
291 aa  190  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
325 aa  169  6e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  38.31 
 
 
285 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 
284 aa  156  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  38.85 
 
 
300 aa  155  7e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
286 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  39.18 
 
 
293 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
289 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
282 aa  143  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
306 aa  136  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  31.89 
 
 
285 aa  135  8e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 
284 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
288 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 
282 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
294 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  34.28 
 
 
281 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
288 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 
282 aa  123  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 
292 aa  122  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  31.97 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
283 aa  115  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 
282 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  30.63 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1637  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  37.67 
 
 
202 aa  113  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1151  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.29 
 
 
203 aa  113  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.637833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
281 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
286 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 
285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0216  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.2 
 
 
204 aa  110  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.72 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  31.23 
 
 
283 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
283 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 
283 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  28.27 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  27.87 
 
 
281 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
282 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
287 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 
280 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.84 
 
 
213 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  28.62 
 
 
287 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0991  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.9 
 
 
206 aa  105  7e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  28.27 
 
 
281 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
284 aa  105  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 
282 aa  105  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
281 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  37.09 
 
 
228 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
333 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.61 
 
 
219 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3801  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.5 
 
 
212 aa  102  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>