More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1880 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 281 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  90.39 
 
 		 294 aa  508  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  64.41 
 
 		 281 aa  368  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  63.7 
 
 		 284 aa  348  6e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  62.41 
 
 		 281 aa  343  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  61.21 
 
 		 280 aa  341  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  60.71 
 
 		 285 aa  336  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  61.57 
 
 		 284 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  60.5 
 
 		 281 aa  331  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  60.07 
 
 		 288 aa  331  8e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  59.3 
 
 		 287 aa  330  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  56.99 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  56.69 
 
 		 284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  58.36 
 
 		 282 aa  326  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 		 282 aa  324  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 		 283 aa  320  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  58.87 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  56.34 
 
 		 287 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  59.93 
 
 		 287 aa  319  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  57.09 
 
 		 282 aa  319  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  57.89 
 
 		 285 aa  319  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  58.51 
 
 		 282 aa  317  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  56.74 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 		 282 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  55.83 
 
 		 282 aa  308  5.9999999999999995e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  55.52 
 
 		 281 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  58.01 
 
 		 287 aa  305  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  56.89 
 
 		 288 aa  299  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  54.93 
 
 		 284 aa  299  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  54.93 
 
 		 283 aa  298  5e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  53.38 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  55.99 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  55.99 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  55.99 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  38.11 
 
 		 295 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  34.3 
 
 		 283 aa  165  8e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  35.23 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  36.46 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 284 aa  151  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  36.79 
 
 		 357 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 286 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 284 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 292 aa  145  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  31.86 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 291 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  34.28 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 		 293 aa  125  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 290 aa  125  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  30.31 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 290 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  26.6 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  30.31 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 297 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  27.3 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  30.31 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  29.62 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 		 291 aa  122  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  27.62 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>