More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0478 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 283 aa  578  1e-164  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  62.68 
 
 		 282 aa  358  5e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  63.03 
 
 		 282 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  60.92 
 
 		 282 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  59.36 
 
 		 280 aa  343  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 		 282 aa  341  5.999999999999999e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  58.89 
 
 		 286 aa  336  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  59.36 
 
 		 284 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  58.6 
 
 		 284 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  58.66 
 
 		 284 aa  331  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  56.54 
 
 		 281 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  55.48 
 
 		 281 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 		 285 aa  312  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  54.33 
 
 		 288 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  54.2 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  55.94 
 
 		 282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 294 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  54.42 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  54.93 
 
 		 281 aa  298  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  53.71 
 
 		 287 aa  295  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  52.11 
 
 		 283 aa  291  8e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 282 aa  288  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  51.93 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  54.79 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  50.18 
 
 		 287 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  51.76 
 
 		 281 aa  281  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  51.06 
 
 		 281 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  50.53 
 
 		 281 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  49.12 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 288 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  50.52 
 
 		 283 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  50.17 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  50.17 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  38.95 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  32.89 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  37 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  34.28 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  32.78 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 295 aa  149  3e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  32.03 
 
 		 300 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 284 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.32 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 288 aa  135  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 305 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 282 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  31.85 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  27.62 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  29.35 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 294 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  27.11 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>