More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2286 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 287 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 		 286 aa  346  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  58.8 
 
 		 281 aa  344  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  60.92 
 
 		 284 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  58.54 
 
 		 287 aa  338  4e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  57.75 
 
 		 281 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  59.09 
 
 		 285 aa  336  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  59.15 
 
 		 280 aa  331  7.000000000000001e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  58.6 
 
 		 282 aa  331  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  57.75 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  57.04 
 
 		 294 aa  328  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  57.39 
 
 		 288 aa  328  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  58.1 
 
 		 284 aa  328  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  56.69 
 
 		 285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  56.14 
 
 		 283 aa  324  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  54.93 
 
 		 282 aa  321  9.000000000000001e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  56.49 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  56.34 
 
 		 281 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  56.84 
 
 		 282 aa  316  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  55.44 
 
 		 282 aa  312  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  55.28 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  55.17 
 
 		 287 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  54.58 
 
 		 281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  53.52 
 
 		 281 aa  302  5.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  52.82 
 
 		 281 aa  301  7.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  53.87 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  54.9 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  53.68 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  53.52 
 
 		 287 aa  291  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  53.52 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  53.52 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3207  ATP phosphoribosyltransferase  53.52 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.690921  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3057  ATP phosphoribosyltransferase  51.06 
 
 		 281 aa  288  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75335  normal  0.157406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  50.18 
 
 		 283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  35.05 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  35.69 
 
 		 357 aa  159  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 283 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  33.77 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  33.67 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.69 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  36.27 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 300 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0588  ATP phosphoribosyltransferase  42.06 
 
 		 217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 		 289 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 		 337 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 297 aa  130  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  33.22 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 299 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  33.68 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 298 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 		 299 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  29.72 
 
 		 294 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  32.4 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>