More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2310 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  99.33 
 
 
299 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  99.33 
 
 
299 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  99.33 
 
 
299 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  95.99 
 
 
299 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  95.99 
 
 
299 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  96.32 
 
 
299 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  95.99 
 
 
299 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  95.65 
 
 
299 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  95.65 
 
 
299 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  91.64 
 
 
299 aa  557  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  90.64 
 
 
299 aa  554  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  90.64 
 
 
299 aa  551  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  89.63 
 
 
299 aa  547  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  88.96 
 
 
299 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  87.96 
 
 
299 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  87.96 
 
 
299 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  87.96 
 
 
299 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  81.61 
 
 
299 aa  506  9.999999999999999e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  68.12 
 
 
332 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  68.71 
 
 
298 aa  424  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  67.79 
 
 
324 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  69.05 
 
 
298 aa  423  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  67.79 
 
 
299 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  68.46 
 
 
299 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  68.37 
 
 
298 aa  420  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  67.79 
 
 
299 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  67.45 
 
 
299 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  67.45 
 
 
299 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  67.45 
 
 
299 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  65.22 
 
 
299 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  67.45 
 
 
299 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  67.45 
 
 
331 aa  419  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  68.03 
 
 
304 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  66.78 
 
 
299 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  65.77 
 
 
299 aa  411  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  66.78 
 
 
299 aa  410  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  66.22 
 
 
299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  65.77 
 
 
299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  65.55 
 
 
300 aa  404  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  66.89 
 
 
297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  66.22 
 
 
299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  65.44 
 
 
299 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  393  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  63.61 
 
 
298 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 
300 aa  352  2.9999999999999997e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
293 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  53.22 
 
 
293 aa  302  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  48.64 
 
 
295 aa  288  8e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  49.32 
 
 
286 aa  278  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
284 aa  272  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  48.31 
 
 
294 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  46.28 
 
 
286 aa  259  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 
287 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  43.81 
 
 
305 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 
285 aa  249  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
283 aa  240  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
304 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  44.22 
 
 
292 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  44.37 
 
 
303 aa  233  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
285 aa  232  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  43.34 
 
 
304 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  43.34 
 
 
304 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
288 aa  180  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
288 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  36.39 
 
 
282 aa  172  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
284 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
288 aa  166  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 
286 aa  165  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
294 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
289 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
284 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
300 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
296 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
300 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
288 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
285 aa  140  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
285 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
280 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
286 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 
284 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  31.31 
 
 
307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 
287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
282 aa  129  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  33.11 
 
 
295 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3157  ATP phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 
283 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  0.585191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>