More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1142 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 287 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  74.91 
 
 		 286 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  64.54 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  62.19 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  56.03 
 
 		 285 aa  347  1e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  55.32 
 
 		 285 aa  329  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  53.36 
 
 		 283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  46.18 
 
 		 295 aa  275  5e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  47.47 
 
 		 299 aa  263  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 298 aa  262  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 		 299 aa  261  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  46.13 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  46.46 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 		 299 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 		 299 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  46.64 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 299 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  45.64 
 
 		 299 aa  255  7e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 299 aa  254  8e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  45.79 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  45.92 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  45.64 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  43.96 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  45.21 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 297 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 		 332 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 299 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  43.77 
 
 		 298 aa  251  9.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  45.55 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 		 298 aa  251  9.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  44.56 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  44.9 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  44.26 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 		 293 aa  246  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 299 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  43 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  43.6 
 
 		 294 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 		 304 aa  205  8e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  35.99 
 
 		 304 aa  192  6e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  36.64 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 285 aa  172  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  35.11 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  29.97 
 
 		 296 aa  149  7e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  32.97 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  30.27 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 		 282 aa  143  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 280 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>