More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3889 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 300 aa  616  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  59.73 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  63.14 
 
 		 299 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  62.67 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  60.33 
 
 		 299 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  59.86 
 
 		 299 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  59.4 
 
 		 332 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 		 299 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  62.79 
 
 		 300 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  60.54 
 
 		 297 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  62.46 
 
 		 299 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  62.12 
 
 		 299 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  61.09 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  60.41 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  61.09 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  61.09 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  60.41 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  58.5 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  58.72 
 
 		 331 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  61.09 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  61.09 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  60.41 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  61.43 
 
 		 299 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 		 299 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  61.09 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  60.94 
 
 		 299 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 		 299 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  61.09 
 
 		 299 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  57.33 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  59.73 
 
 		 299 aa  366  1e-100  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  58.16 
 
 		 299 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  59.73 
 
 		 304 aa  364  1e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  57.68 
 
 		 299 aa  361  8e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  58.98 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  58.7 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 		 298 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  58.11 
 
 		 298 aa  348  7e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 		 299 aa  342  4e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  57.68 
 
 		 299 aa  342  5e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 		 299 aa  339  2.9999999999999998e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  50.17 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  49.83 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  49.49 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  45.89 
 
 		 286 aa  263  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  44.9 
 
 		 294 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  44.18 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  44.52 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 		 283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  43.15 
 
 		 285 aa  241  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  38.7 
 
 		 285 aa  229  6e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  40.94 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  38.57 
 
 		 303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  37.41 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  38.03 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 		 286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 285 aa  144  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  31.92 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 300 aa  143  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  34.71 
 
 		 288 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 283 aa  129  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 282 aa  129  8.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10900  ATP phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>