More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2880 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  83 
 
 		 300 aa  514  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  65.77 
 
 		 299 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 		 299 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  397  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 		 299 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 		 299 aa  398  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0642923 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 		 299 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  64.43 
 
 		 299 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  63.88 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  63.55 
 
 		 324 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  63.09 
 
 		 299 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  63.09 
 
 		 299 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  63.09 
 
 		 299 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  63.55 
 
 		 332 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  63.55 
 
 		 299 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  64.21 
 
 		 299 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  65.76 
 
 		 298 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  63.55 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  63.21 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  65.76 
 
 		 298 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  63.67 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  63.21 
 
 		 299 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  64.75 
 
 		 304 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  63.82 
 
 		 298 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  62.21 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  62.54 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  62.21 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  62.21 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  62.21 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  62.21 
 
 		 299 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  62.67 
 
 		 300 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  60.07 
 
 		 299 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  64.07 
 
 		 298 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  61.22 
 
 		 297 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  59.4 
 
 		 299 aa  365  1e-100  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  61.2 
 
 		 299 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000183123  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  61.07 
 
 		 299 aa  361  9e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  60.74 
 
 		 299 aa  358  5e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  52.04 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  51.36 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  51.02 
 
 		 295 aa  287  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  45.42 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  47.1 
 
 		 284 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 		 287 aa  258  6e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  44.63 
 
 		 286 aa  246  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  41.89 
 
 		 304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 		 305 aa  228  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  41.41 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 		 285 aa  226  4e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  41.16 
 
 		 303 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 		 284 aa  169  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  35.53 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 288 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 		 285 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  33.99 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  33.66 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  32.31 
 
 		 295 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 286 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  31.58 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>