More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1559 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
325 aa  660    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
290 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  36.25 
 
 
291 aa  195  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
289 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
291 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  35.51 
 
 
291 aa  186  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
310 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 
286 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
294 aa  179  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
289 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 
290 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 
294 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
297 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  32.7 
 
 
292 aa  176  4e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 
294 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  32.79 
 
 
294 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  35.1 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
294 aa  172  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 
293 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
293 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
290 aa  169  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 
290 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
293 aa  166  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  31.46 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
290 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
289 aa  162  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  32.27 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
291 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 
291 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
297 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 
291 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
291 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
291 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  34.53 
 
 
293 aa  142  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 
286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.13 
 
 
300 aa  132  9e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
306 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
284 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  28 
 
 
333 aa  119  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
288 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  27.18 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  28.9 
 
 
289 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 
282 aa  116  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  29.9 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 
285 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
284 aa  113  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 
294 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0845  ATP phosphoribosyltransferase, putaitve  30.08 
 
 
468 aa  112  9e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_749  ATP phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
468 aa  112  9e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.382226  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0764  ATP phosphoribosyltransferase, catalytic region  29.67 
 
 
468 aa  109  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 
337 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 
292 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  26.75 
 
 
307 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 
353 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.6 
 
 
284 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
286 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  26.33 
 
 
287 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  26.41 
 
 
338 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  26.81 
 
 
282 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.82 
 
 
338 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
282 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  24.2 
 
 
287 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
285 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  27.76 
 
 
282 aa  100  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.43 
 
 
213 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  25.99 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  28.09 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 
283 aa  95.9  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  24.76 
 
 
285 aa  95.9  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  27.36 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  27 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  22.65 
 
 
281 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 
554 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  23.34 
 
 
287 aa  93.2  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  25.08 
 
 
295 aa  92.4  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1101  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  27.48 
 
 
216 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.449709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  22.33 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  23.41 
 
 
282 aa  91.3  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  26.3 
 
 
282 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1151  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.4 
 
 
203 aa  90.5  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.637833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  25.25 
 
 
284 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  27.17 
 
 
283 aa  90.5  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  23.33 
 
 
357 aa  89.7  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  23.1 
 
 
282 aa  89.7  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
284 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  23.3 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  21.64 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02190  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
223 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0242064  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0991  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.36 
 
 
206 aa  88.2  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>