289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_749 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0845  ATP phosphoribosyltransferase, putaitve  100 
 
 
468 aa  966    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_749  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
468 aa  966    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.382226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0764  ATP phosphoribosyltransferase, catalytic region  95.73 
 
 
468 aa  938    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 
290 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  31.42 
 
 
291 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
290 aa  103  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
290 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
290 aa  100  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 
291 aa  99.8  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 
291 aa  95.9  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
291 aa  94.4  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
310 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
288 aa  92.8  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
294 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 
294 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 
292 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
297 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
294 aa  89  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 
294 aa  89  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 
286 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 
286 aa  87  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 
294 aa  86.7  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 
289 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  27.95 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  29.39 
 
 
291 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 
290 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
286 aa  82.4  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  31.7 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  29.39 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  27.83 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
291 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  27.83 
 
 
291 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
306 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.83 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
325 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
297 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
291 aa  77  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
325 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
288 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  28.89 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  26.2 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  28.95 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0750  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.97 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.986407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 
353 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
284 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
325 aa  72.4  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.04 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.17 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  25.11 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  24.78 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.33 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
325 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1637  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.56 
 
 
202 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1491  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  25.85 
 
 
223 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0152301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0783  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.95 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.762913  normal  0.617783 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02190  ATP phosphoribosyltransferase  28.84 
 
 
223 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0242064  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2764  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  28.71 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.216973  hitchhiker  0.00563618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2356  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  28.76 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000440945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3353  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  28.71 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  26.92 
 
 
231 aa  68.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4058  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.04 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441142  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1078  ATP phosphoribosyltransferase  30.05 
 
 
554 aa  67.4  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00640346  hitchhiker  0.0000000000210065 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1151  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.21 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.637833  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
292 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1903  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.78 
 
 
231 aa  67  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000125958  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2193  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.78 
 
 
231 aa  67  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000274896  normal  0.0321115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  28.04 
 
 
344 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4346  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29 
 
 
218 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5072  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30 
 
 
215 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.746363 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 
325 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2454  ATP phosphoribosyltransferase  27.48 
 
 
214 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  25.78 
 
 
330 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  26.83 
 
 
325 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 
284 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  25.97 
 
 
293 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1120  ATP phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 
207 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0051098  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
294 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
291 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0502  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.23 
 
 
223 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3801  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.68 
 
 
212 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0991  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.26 
 
 
206 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3706  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  27.68 
 
 
212 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  31.5 
 
 
282 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
325 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>