More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4933 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 344 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  93.29 
 
 		 327 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  80.43 
 
 		 325 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  80.07 
 
 		 325 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  82.08 
 
 		 330 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  78.85 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  63.64 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  64.39 
 
 		 325 aa  342  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  61.75 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  62.45 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  61.97 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  64.75 
 
 		 324 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  60.21 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  61.15 
 
 		 325 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  59.93 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  63.91 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  61.95 
 
 		 231 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  59.13 
 
 		 231 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  60.39 
 
 		 230 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  59.02 
 
 		 230 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.05 
 
 		 231 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.54 
 
 		 231 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.65 
 
 		 231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.17 
 
 		 231 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  56.2 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.93 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.34 
 
 		 230 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.22 
 
 		 237 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.86 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.44 
 
 		 236 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.44 
 
 		 236 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.86 
 
 		 225 aa  177  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  41.37 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  37.7 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  37.6 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.8 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  31.37 
 
 		 386 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  29.96 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 		 285 aa  96.3  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  28.34 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 288 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 		 290 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 		 284 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 		 283 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 290 aa  89.4  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  34.06 
 
 		 282 aa  88.6  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 286 aa  88.2  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 		 286 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.64 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 290 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  35.75 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  27.67 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  34.17 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1637  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.58 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  33.33 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  28.52 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0632  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  34.66 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 284 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  33.46 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5474  ATP phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.469215  normal  0.169247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  34.18 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.05 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  31.5 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0391  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.6 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>