More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2566 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
325 aa  655    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  91.98 
 
 
325 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  87.04 
 
 
325 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  84.52 
 
 
325 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  83.64 
 
 
325 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  83.08 
 
 
325 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  83.95 
 
 
325 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  65.94 
 
 
324 aa  436  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  63.32 
 
 
325 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  60.94 
 
 
325 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  60.62 
 
 
325 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  59.56 
 
 
330 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  60 
 
 
327 aa  361  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  58.93 
 
 
325 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 
325 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 
325 aa  352  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  62.5 
 
 
344 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.72 
 
 
230 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.09 
 
 
231 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.84 
 
 
231 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.41 
 
 
231 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.34 
 
 
230 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.22 
 
 
231 aa  242  5e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.1 
 
 
231 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.08 
 
 
231 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  54.94 
 
 
331 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.33 
 
 
239 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.14 
 
 
230 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.07 
 
 
237 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.54 
 
 
236 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.54 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.6 
 
 
232 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 
338 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 
353 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  44.93 
 
 
225 aa  175  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
337 aa  168  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 
333 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  30.51 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  30.24 
 
 
386 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  26.84 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  27.47 
 
 
306 aa  102  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 
300 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 
286 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
285 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 
284 aa  99  9e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  26.18 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.81 
 
 
286 aa  97.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 
288 aa  96.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  26.01 
 
 
288 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 
282 aa  96.3  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  27.33 
 
 
300 aa  95.9  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  31.64 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  29.81 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 
283 aa  92.8  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 
285 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0632  ATP phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
204 aa  87.4  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  35.92 
 
 
282 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
290 aa  87  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  26.69 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.03 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  30.81 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
299 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  31.22 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4058  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.14 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.441142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2689  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.44 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  28.34 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  0.00000000491094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  32.57 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  29.13 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.73 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  27.94 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  27.13 
 
 
286 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>