More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1498 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 325 aa  639    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  96.62 
 
 		 325 aa  618  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  96.92 
 
 		 325 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  85.05 
 
 		 330 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  78.19 
 
 		 327 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  78.91 
 
 		 344 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  63.27 
 
 		 325 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  62.73 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  58.26 
 
 		 325 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  58.93 
 
 		 325 aa  358  9e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  59.19 
 
 		 325 aa  355  5e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  57.93 
 
 		 325 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  56.7 
 
 		 325 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  59.08 
 
 		 325 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  56.7 
 
 		 325 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  56.88 
 
 		 325 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.77 
 
 		 231 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.53 
 
 		 230 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.89 
 
 		 230 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.67 
 
 		 231 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.5 
 
 		 231 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.98 
 
 		 231 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.76 
 
 		 231 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.3 
 
 		 231 aa  228  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  55.65 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.36 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.55 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 		 237 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.55 
 
 		 232 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.7 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.7 
 
 		 236 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 		 353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  40.06 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.34 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 		 333 aa  175  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  37.54 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.55 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  30.54 
 
 		 386 aa  132  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  34.02 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.03 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 294 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.74 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  28.94 
 
 		 285 aa  99  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  34.9 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 284 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  28.53 
 
 		 286 aa  97.1  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.57 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  28.25 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  29.52 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  26.47 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  31.07 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  28.71 
 
 		 299 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  32.07 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  29.92 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  30.39 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  28.34 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 282 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2919  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.7 
 
 		 223 aa  81.6  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.32 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0393  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.22 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  27.39 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0363  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.22 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  27.62 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0391  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.22 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4216  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.15 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  28.69 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>