More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0947 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
232 aa  462  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  66.96 
 
 
230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  69.47 
 
 
237 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  68.02 
 
 
239 aa  290  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  71.03 
 
 
236 aa  288  6e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  70.56 
 
 
236 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  67.62 
 
 
225 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  47.84 
 
 
330 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
325 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  46.98 
 
 
325 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
325 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 
327 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  47.86 
 
 
344 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  48.61 
 
 
325 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.76 
 
 
230 aa  198  7e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  47.6 
 
 
325 aa  198  7e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
325 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.92 
 
 
231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.47 
 
 
230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  47.16 
 
 
325 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  46.12 
 
 
325 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.44 
 
 
231 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  46.72 
 
 
325 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 
325 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.43 
 
 
231 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.83 
 
 
231 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  46.29 
 
 
325 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.1 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  45.69 
 
 
324 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  47.62 
 
 
231 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  44.35 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 
331 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  40.55 
 
 
333 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  40.17 
 
 
338 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  40.57 
 
 
353 aa  134  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  37.68 
 
 
338 aa  132  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  40.99 
 
 
337 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
288 aa  96.7  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  29.02 
 
 
386 aa  96.3  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
284 aa  94.4  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  30.52 
 
 
286 aa  89.4  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 
284 aa  87.8  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
286 aa  86.3  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  31.96 
 
 
295 aa  86.3  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
289 aa  85.1  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 
300 aa  85.1  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  27.68 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.63 
 
 
282 aa  82  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
288 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  30.73 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  32.99 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 
288 aa  79  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
293 aa  79  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
297 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  30.04 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  29.26 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.98 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
291 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  27.9 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  27.63 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_006686  CND01510  ATP phosphoribosyltransferase, putative  28.97 
 
 
357 aa  75.5  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  29.28 
 
 
285 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  33.84 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  30.54 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  27.16 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  27.47 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  30.63 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  26.61 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  26.61 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  26.84 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  26.84 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  26.84 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  26.84 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 
303 aa  72  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0726  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.48 
 
 
216 aa  72  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>