More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1497 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 325 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  99.69 
 
 		 325 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  96.62 
 
 		 325 aa  618  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  84.74 
 
 		 330 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  79.26 
 
 		 327 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  80.51 
 
 		 344 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  62.46 
 
 		 325 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  61.96 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 		 324 aa  361  9e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  57.76 
 
 		 325 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  58.02 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  56.52 
 
 		 325 aa  351  7e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  58.39 
 
 		 325 aa  352  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  57.32 
 
 		 325 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  56.29 
 
 		 325 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  58.59 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  59.15 
 
 		 231 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  58.06 
 
 		 230 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  57.89 
 
 		 230 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.4 
 
 		 231 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.98 
 
 		 231 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.5 
 
 		 231 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  56.19 
 
 		 231 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  55.7 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  55.71 
 
 		 231 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.55 
 
 		 230 aa  212  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  50.45 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.98 
 
 		 232 aa  211  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.16 
 
 		 237 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.77 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  49.77 
 
 		 236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.86 
 
 		 225 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  38.44 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  29.46 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  29.59 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  33.03 
 
 		 284 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  35.57 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  30.89 
 
 		 285 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.21 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 300 aa  96.3  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 286 aa  95.9  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  33.44 
 
 		 282 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  30.97 
 
 		 283 aa  92.4  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  89.7  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27.83 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  32.49 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 		 282 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.26 
 
 		 282 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 305 aa  86.3  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  27.04 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  29.64 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5380  ATP phosphoribosyltransferase  28.29 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  28.34 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  31.32 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  28.43 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0393  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.22 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  27.8 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0363  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.22 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1205  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  29.82 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0391  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.22 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>