More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0419 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0419  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  100 
 
 
230 aa  460  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189396  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3019  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  73.91 
 
 
231 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.19386  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0189  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  72.49 
 
 
231 aa  334  5.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0171  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  72.49 
 
 
231 aa  333  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0528431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0405  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  70.31 
 
 
231 aa  320  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.417772  normal  0.0711968 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0466  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  69.43 
 
 
231 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0800335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0511  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  70.7 
 
 
231 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0322092 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5794  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  66.38 
 
 
230 aa  304  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1680  ATP phosphoribosyltransferase  59.64 
 
 
325 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1340  ATP phosphoribosyltransferase  58.18 
 
 
325 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2566  ATP phosphoribosyltransferase  57.34 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4118  ATP phosphoribosyltransferase  58.6 
 
 
325 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.664932  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1845  ATP phosphoribosyltransferase  59.71 
 
 
325 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1498  ATP phosphoribosyltransferase  58.53 
 
 
325 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.535692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2645  ATP phosphoribosyltransferase  59.9 
 
 
327 aa  239  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940069  normal  0.223028 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1497  ATP phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
325 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.123629  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4933  ATP phosphoribosyltransferase  60.39 
 
 
344 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.724912  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4293  ATP phosphoribosyltransferase  58.77 
 
 
330 aa  238  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766083  normal  0.0203062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1776  ATP phosphoribosyltransferase  58.06 
 
 
325 aa  238  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0240308  normal  0.1933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4718  ATP phosphoribosyltransferase  57.48 
 
 
325 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.659271  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0600  ATP phosphoribosyltransferase  58.94 
 
 
325 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.159255  normal  0.261464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3188  ATP phosphoribosyltransferase  56.76 
 
 
325 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0803  ATP phosphoribosyltransferase  54.75 
 
 
325 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.075937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1774  ATP phosphoribosyltransferase  53.81 
 
 
325 aa  224  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0456456  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4747  ATP phosphoribosyltransferase  57.56 
 
 
324 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.884171 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.23 
 
 
237 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0231756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2953  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.9 
 
 
239 aa  208  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.845161  normal  0.0412161 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0505  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  46.93 
 
 
230 aa  204  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3549  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.89 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3232  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  48.89 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0947  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  51.47 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167643  normal  0.258269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2907  ATP phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
338 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133026  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3180  ATP phosphoribosyltransferase  45.53 
 
 
353 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200263  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4679  ATP phosphoribosyltransferase  52.68 
 
 
331 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1923  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  45.37 
 
 
225 aa  174  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2634  ATP phosphoribosyltransferase  44.23 
 
 
333 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0578  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  40.69 
 
 
338 aa  161  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2185  ATP phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 
337 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.94631 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28808  predicted protein  34.76 
 
 
386 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.329195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  37.95 
 
 
284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
289 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 
288 aa  104  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 
285 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  35.24 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.71 
 
 
285 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 
288 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
300 aa  95.9  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
288 aa  95.5  7e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 
288 aa  95.1  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  38.78 
 
 
285 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 
286 aa  93.6  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  34.29 
 
 
295 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0695  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.59659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 
293 aa  88.2  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0550  ATP phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.775439  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  34.72 
 
 
300 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  36.79 
 
 
291 aa  87.8  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
283 aa  87  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
286 aa  86.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2036  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.32 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  32 
 
 
299 aa  86.3  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
292 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 
291 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  34.87 
 
 
294 aa  85.5  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
284 aa  85.5  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 
282 aa  85.5  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
282 aa  85.5  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.81 
 
 
290 aa  85.1  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2945  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33 
 
 
212 aa  85.1  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0803  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.51 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3388  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.67 
 
 
214 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1586  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  35.08 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0087708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  32.02 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1164  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  36.32 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0830  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  34.9 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81865  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
292 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02190  ATP phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 
223 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0242064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5526  ATP phosphoribosyltransferase  35.47 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1555  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit / ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.16 
 
 
535 aa  81.3  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1016  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  32.46 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2174  ATP phosphoribosyltransferase  29.23 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  33.02 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  35.38 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1023  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  33.83 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.9488  normal  0.701782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  32.69 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1000  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  26.94 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.826132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
291 aa  79  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1890  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.39 
 
 
216 aa  79  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1309  ATP phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.212577 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0820  ATP phosphoribosyltransferase catalytic subunit  30.5 
 
 
227 aa  79  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 
282 aa  78.6  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  32.51 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
299 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>