More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4254 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 681 aa  1352    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000333563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  62.25 
 
 		 1418 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  57.53 
 
 		 948 aa  264  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.59 
 
 		 1436 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.57 
 
 		 1436 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  54.58 
 
 		 994 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4605  histidine protein kinase  51 
 
 		 1309 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.292459  normal  0.0589738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4067  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.36 
 
 		 1490 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.16 
 
 		 1480 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.63 
 
 		 1485 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.42 
 
 		 1255 aa  220  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.63 
 
 		 817 aa  219  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0654  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 		 934 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.26 
 
 		 1442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 		 827 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 636 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 		 1369 aa  213  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.82 
 
 		 1199 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 		 1069 aa  212  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  38.63 
 
 		 1001 aa  211  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 919 aa  210  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  42.32 
 
 		 882 aa  210  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 		 1033 aa  210  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.53 
 
 		 957 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  47.35 
 
 		 729 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 		 780 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  44.4 
 
 		 819 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0210  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.4 
 
 		 708 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.29 
 
 		 1240 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.54 
 
 		 1194 aa  207  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0814409  normal  0.0127622 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  46.78 
 
 		 1135 aa  207  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 		 882 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.49 
 
 		 929 aa  206  8e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  43.36 
 
 		 1653 aa  206  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.6 
 
 		 1199 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  45.33 
 
 		 1322 aa  206  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  40.96 
 
 		 1014 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0407  ATP-binding region, ATPase-like  45.16 
 
 		 650 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.41 
 
 		 765 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  37.39 
 
 		 620 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.89 
 
 		 1426 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 923 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 864 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.04 
 
 		 1433 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 		 916 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 833 aa  205  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.13 
 
 		 1202 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.23 
 
 		 705 aa  204  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.05 
 
 		 752 aa  204  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 		 690 aa  204  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 		 1237 aa  204  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.473456  normal  0.0283242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  44.44 
 
 		 977 aa  203  7e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.89 
 
 		 1177 aa  203  8e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  37.18 
 
 		 783 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 		 1287 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.6 
 
 		 713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  38.32 
 
 		 925 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 631 aa  201  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.61 
 
 		 1127 aa  201  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 1313 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.03 
 
 		 1350 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 743 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 827 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.93 
 
 		 903 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  45.21 
 
 		 786 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  46 
 
 		 1122 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.55 
 
 		 606 aa  201  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.43 
 
 		 801 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 		 1021 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  38.49 
 
 		 925 aa  201  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.06 
 
 		 1072 aa  201  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.82 
 
 		 899 aa  201  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  41.32 
 
 		 833 aa  200  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  39.63 
 
 		 661 aa  200  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 1820 aa  200  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 		 757 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.27 
 
 		 1398 aa  200  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3723  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 903 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.803649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 1075 aa  200  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1887  transmission sensor LetS  31.59 
 
 		 910 aa  199  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.98 
 
 		 995 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.31 
 
 		 1397 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.42 
 
 		 853 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  41.85 
 
 		 1346 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 		 1358 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.82 
 
 		 1001 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 		 1550 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003637  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1055 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.42 
 
 		 745 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3563  multi-sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 		 1023 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000544  hypothetical protein  38.77 
 
 		 828 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  45.56 
 
 		 847 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 		 881 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 		 1260 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.78 
 
 		 919 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  44.91 
 
 		 945 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.2 
 
 		 1611 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.69 
 
 		 1316 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.62 
 
 		 796 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.06 
 
 		 957 aa  197  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>