More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_4215 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009365  OSTLU_4215  predicted protein  100 
 
 		 357 aa  738    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33477  DRAP deaminase  31.68 
 
 		 585 aa  186  7e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.261571 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10936  DRAP deaminase (Rib2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16360)  35.48 
 
 		 572 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292006 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14067  predicted protein  38.1 
 
 		 271 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.952518  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02470  conserved hypothetical protein  36.5 
 
 		 520 aa  149  6e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0281406  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61490  DRAP deaminase and pseudouridylate synthase  26.23 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  31.46 
 
 		 623 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1344  pseudouridine synthase, RluA family  30.58 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  31.6 
 
 		 235 aa  99  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3169  pseudouridylate synthase  31.91 
 
 		 278 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8859  predicted protein  35.84 
 
 		 168 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00776718  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  33.5 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3289  pseudouridine synthase  32.11 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.629665  hitchhiker  0.00000299463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2891  pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 284 aa  94  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2615  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.5 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0357699  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1865  RluA family pseudouridine synthase  33.16 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  35.87 
 
 		 299 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3230  RluA family pseudouridine synthase  31.17 
 
 		 320 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0713  tRNA pseudouridine synthase C  27.06 
 
 		 263 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1163  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.8 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1083  pseudouridine synthase, RluA family  30.8 
 
 		 334 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0421612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2643  pseudouridylate synthase  31.03 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.998826 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  30.65 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.12 
 
 		 322 aa  87.8  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  34.16 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.61 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08290  pseudouridine synthase, RluA family  32.12 
 
 		 310 aa  87  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2894  tRNA pseudouridine synthase C  34.74 
 
 		 261 aa  86.7  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0617  pseudouridine synthase  31.61 
 
 		 314 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2314  pseudouridine synthase, RluD  30.93 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.651442  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1546  pseudouridylate synthase  30.54 
 
 		 298 aa  86.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2524  pseudouridylate synthase  31.03 
 
 		 230 aa  86.7  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2650  tRNA pseudouridine synthase C  32.2 
 
 		 284 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0596  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.28 
 
 		 308 aa  86.7  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000579613  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  29.69 
 
 		 311 aa  85.9  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2824  tRNA pseudouridine synthase C  32.5 
 
 		 284 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  29.17 
 
 		 311 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1339  pseudouridylate synthase  32.51 
 
 		 275 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2875  RluA family pseudouridine synthase  33 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.767163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1358  pseudouridine synthase, RluA family  31.94 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364414  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0611  pseudouridine synthase  32.49 
 
 		 241 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  31.61 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2911  pseudouridine synthase  32.46 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2717  tRNA pseudouridine synthase C  32.5 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1589  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.77 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0462053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.19 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1442  pseudouridine synthase  31.94 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1472  pseudouridine synthase  31.94 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1436  pseudouridine synthase  31.94 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1383  pseudouridine synthase, RluA family  29.58 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2503  RluA family pseudouridine synthase  31.18 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.721496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0386  RluA family pseudouridine synthase  27.62 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  34.67 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5191  pseudouridine synthase, RluA family  28.4 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000721787 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  26.91 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.6 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  29.19 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1262  pseudouridylate synthase  30.53 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.308846  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  29.19 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1131  pseudouridylate synthase  29.56 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  34.05 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0279  pseudouridine synthase  31.5 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000931063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1840  RluA family pseudouridine synthase  29.73 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0345  pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.96 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5026  RluA family pseudouridine synthase  32.8 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.257508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  30.6 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.95 
 
 		 300 aa  82.8  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  30.69 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  31.41 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1065  pseudouridine synthase, RluD  34.52 
 
 		 328 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.901288  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0774  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.61 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0916  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3611  RluA family pseudouridine synthase  30.5 
 
 		 327 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.354938  hitchhiker  0.00827113 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  30.12 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  30.37 
 
 		 306 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0736  RluA family pseudouridine synthase  27.1 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2404  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.11 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.11 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0799284  normal  0.0195489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.51 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  32.64 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2566  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.65 
 
 		 329 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00643292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0583  pseudouridine synthase, RluA family  27.73 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  28.57 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1287  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (pseudouridylate synthase) (Uracil hydrolyase)  29.09 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1286  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D (pseudouridylate synthase) (Uracil hydrolyase)  29.09 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.32 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0522  pseudouridine synthase, RluA family  25.09 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  30.61 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  32.29 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  32.97 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1594  RluA family pseudouridine synthase  28.77 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260553  normal  0.0130241 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.19 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  34.05 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0998  pseudouridine synthase, RluA family  35.6 
 
 		 547 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.012801 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0854  tRNA pseudouridine synthase C  28.69 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000219419  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  32.28 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  27.1 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135219 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  30.37 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2180  pseudouridine synthase, RluA family  32.81 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1373  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.52 
 
 		 312 aa  80.5  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>