More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27488 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009368  OSTLU_27488  predicted protein  100 
 
 		 318 aa  639    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2639  pseudouridine synthase  35.79 
 
 		 299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2207  pseudouridine synthase  35.56 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.754235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0004  pseudouridine synthase  33.84 
 
 		 307 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105413 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1169  pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000063461  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1479  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.58 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0352781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  30.42 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1958  RluA family pseudouridine synthase  33.82 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.576308  normal  0.790812 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2505  RluA family pseudouridine synthase  33.83 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0291  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  32.33 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0998  pseudouridine synthase, RluA family  33.57 
 
 		 547 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.012801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1083  pseudouridine synthase, RluA family  34.46 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0421612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1745  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  33.21 
 
 		 346 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3536  ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluD subfamily  33.1 
 
 		 342 aa  99  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.618363  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2290  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.89 
 
 		 360 aa  99  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1163  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.08 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5026  RluA family pseudouridine synthase  33.33 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.257508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  32.43 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0391  RluA family pseudouridine synthase  32.34 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1005  RluA family pseudouridine synthase  31.14 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1614  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.42 
 
 		 315 aa  97.4  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109224  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1622  pseudouridine synthase, RluD  31.21 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  30.43 
 
 		 304 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0968  pseudouridine synthase, RluA family  30.8 
 
 		 343 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  30.4 
 
 		 311 aa  95.9  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  29.24 
 
 		 306 aa  95.1  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  30.66 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  30.38 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.1 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.1 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0218  pseudouridine synthase, RluA family  34.74 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0966  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.36 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.948591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  28.06 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.41 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.91 
 
 		 303 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  28.42 
 
 		 306 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1601  23S rRNA pseudouridylate synthase C  31.2 
 
 		 315 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000249423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.09 
 
 		 322 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3230  RluA family pseudouridine synthase  31.46 
 
 		 320 aa  92.8  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1000  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28 
 
 		 326 aa  92.8  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0087  RluA family pseudouridine synthase  33.84 
 
 		 344 aa  92.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  29.89 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1072  RluA family pseudouridine synthase  30.21 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0863187  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.49 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.85 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  27.84 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.23 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08006  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.27 
 
 		 356 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1865  RluA family pseudouridine synthase  32.2 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0207  pseudouridine synthase, RluA family  33.22 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.604096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2615  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.58 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0357699  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3345  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 333 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2133  RluA family pseudouridine synthase  27.3 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5641  RluA family pseudouridine synthase  30.18 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0784245  normal  0.0662389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  29.89 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002989  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  27.4 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  29.58 
 
 		 336 aa  90.1  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2164  RluA family pseudouridine synthase  29.12 
 
 		 482 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.317837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3401  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.9 
 
 		 310 aa  90.1  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0963  pseudouridine synthase  30.77 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.334173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2215  RluA family pseudouridine synthase  31.62 
 
 		 341 aa  89.7  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  31.02 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02917  rRNA ribosomal pseudouridine synthase  29.45 
 
 		 339 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  27.21 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1115  pseudouridine synthase, RluA family  28.72 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.494763 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02339  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (pseudouridylate synthase) (uracil hydrolyase  27.27 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.336245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  29.96 
 
 		 304 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3480  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.28 
 
 		 348 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0583016 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1324  pseudouridine synthase, RluA family  29.93 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3442  RluA family pseudouridine synthase  32.41 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.56048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7584  pseudouridine synthase, RluA family  32.99 
 
 		 337 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0816319  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0714  23S rRNA pseudouridylate synthase C  28.93 
 
 		 326 aa  89  9e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  27.54 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  29.29 
 
 		 305 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0439  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.66 
 
 		 322 aa  88.2  1e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0553  pseudouridine synthase, RluA family  29.92 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.18 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  31.16 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3457  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  30.8 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  31.34 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  27.87 
 
 		 341 aa  87.8  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  29.96 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2083  RluA family pseudouridine synthase  28.78 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0730  RluA family pseudouridine synthase  27.27 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0504919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  31.64 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  29.96 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1988  pseudouridylate synthase  29.89 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00771455  normal  0.0114075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2234  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C (rRNA uridine isomerase C) (rRNA pseudouridylate synthase C)  29.43 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0928032  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2409  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.55 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1495  pseudouridine synthase, RluA family  28.52 
 
 		 354 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1390  pseudouridine synthase  26.24 
 
 		 255 aa  87.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.371905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  30.97 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.48 
 
 		 403 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  29.56 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1616  pseudouridine synthase, RluA family  30.24 
 
 		 320 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1721  pseudouridine synthase, RluD  31.16 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22000  pseudouridine synthase RluA  30.84 
 
 		 211 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.921344  hitchhiker  0.0000000000442265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1220  ribosomal pseudouridine synthase  26.38 
 
 		 323 aa  86.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6367  RluA family pseudouridine synthase  30.26 
 
 		 469 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.129788  normal  0.347421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0624  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  28.78 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>