More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3442 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3442  RluA family pseudouridine synthase  100 
 
 		 295 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.56048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3379  pseudouridine synthase, RluD  79.93 
 
 		 300 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3526  pseudouridine synthase, RluA family  79.02 
 
 		 287 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.276057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3462  pseudouridine synthase, RluA family  79.37 
 
 		 287 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1958  RluA family pseudouridine synthase  48.23 
 
 		 293 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.576308  normal  0.790812 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.52 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  38.14 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1978  pseudouridine synthase, RluA family  45.11 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.83 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2063  pseudouridine synthase, RluA family  44.79 
 
 		 352 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.585518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1901  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  44.16 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0554937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  43.19 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.82 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  38.98 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  34.88 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.03 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  35.6 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.23 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.28 
 
 		 319 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0878  pseudouridine synthase RluA family  37.75 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.936233  normal  0.697349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  32.44 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1849  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.77 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.97184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0395  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  32.33 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.134097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.62 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0928054  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  35.64 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.5 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  38.74 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  38.51 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.66 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997976  normal  0.952064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.98 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  33 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  32.12 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  32.12 
 
 		 306 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  33.44 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2574  pseudouridine synthase, RluA family  38.67 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0131416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1969  RluA family pseudouridine synthase  37.05 
 
 		 541 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.434828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  32.67 
 
 		 305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1440  pseudouridine synthase, RluA family  33.54 
 
 		 347 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.738263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3195  pseudouridine synthase, RluA family  37.17 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000221583  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.01 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  29.49 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  29.79 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2911  pseudouridine synthase, RluA family  37 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000259384  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  38.13 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  30.33 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.58 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  34.19 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.31 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  36.75 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  34.53 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.65 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2719  RluA family pseudouridine synthase  38.69 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.344852  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10900  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.44 
 
 		 308 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3396  pseudouridine synthase, RluA family  33.55 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.685542  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  32 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13500  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.14 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  32 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  31.94 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0604  pseudouridine synthase, RluD  38.91 
 
 		 341 aa  145  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.206987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5746  pseudouridine synthase, RluA family  34.98 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2467  pseudouridine synthase, RluA family  37.33 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.235173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1420  pseudouridine synthase, RluA family  35.97 
 
 		 310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.276517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  32.46 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  33.45 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  29.51 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  36.18 
 
 		 315 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22700  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.75 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.17143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  33.11 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.44 
 
 		 303 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  32.2 
 
 		 329 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  33.43 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2551  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.12 
 
 		 321 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.682293  hitchhiker  0.00325884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.87 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3639  RluA family pseudouridine synthase  35.86 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.323041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  37.38 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5735  pseudouridine synthase, RluA family  35.2 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3459  pseudouridine synthase, RluA family  33.55 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0778  pseudouridine synthase, RluA family  30.26 
 
 		 318 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0749  pseudouridine synthase, RluA family  30.59 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1742  pseudouridine synthase, RluD  34.28 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0441246 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  32.88 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1622  pseudouridine synthase, RluD  31.13 
 
 		 363 aa  143  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.46 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  31.27 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1447  pseudouridine synthase, RluD  34.81 
 
 		 578 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27270  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.13 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.42777  normal  0.302751 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  32.82 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2995  pseudouridine synthase, RluA family  34.85 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3092  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.54 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.598347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  32.78 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3152  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.54 
 
 		 304 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  35.33 
 
 		 400 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1426  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.27 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128873  normal  0.0393122 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2774  RluA family pseudouridine synthase  35.1 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.538883  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  32.94 
 
 		 341 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11573  pseudouridylate synthase  36.42 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6848  RluA family pseudouridine synthase  36.22 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.13 
 
 		 334 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0431  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.74 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  31.4 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>