More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0778 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0778  pseudouridine synthase, RluA family  100 
 
 
318 aa  647    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0749  pseudouridine synthase, RluA family  98.43 
 
 
318 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1515  pseudouridine synthase, RluA family  70.03 
 
 
306 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0647442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2924  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  64.52 
 
 
312 aa  415  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459608  normal  0.0830361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3490  pseudouridine synthase, RluA family  65.27 
 
 
329 aa  408  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.788611  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1849  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  63.9 
 
 
316 aa  407  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.97184  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  65.36 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1112  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  59.81 
 
 
313 aa  378  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0997976  normal  0.952064 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  55.89 
 
 
324 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2457  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  53.51 
 
 
333 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  54.55 
 
 
326 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  54.21 
 
 
326 aa  308  9e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2141  pseudouridine synthase, RluD  52.86 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02221  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  51.35 
 
 
320 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.135305  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1911  pseudouridine synthase, RluA family  49.51 
 
 
304 aa  291  7e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  50.17 
 
 
319 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  51.46 
 
 
303 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0195  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  50.17 
 
 
319 aa  287  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0799995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1041  pseudouridine synthase, RluA family  50 
 
 
304 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000866742  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02131  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  49.83 
 
 
319 aa  287  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  50.5 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  49.19 
 
 
331 aa  285  5e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3719  RluA family pseudouridine synthase  46.41 
 
 
302 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00132143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  52.2 
 
 
306 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3937  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.08 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000762664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3743  RNA pseudouridylate synthase  46.08 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00315275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3651  pseudouridylate synthase (pseudouridine synthase)  46.08 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3906  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  46.08 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000340417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2541  RluA family pseudouridine synthase  48.32 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.15335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3993  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  46.08 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000288046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1248  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  47.65 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000362529  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3944  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluA family  46.08 
 
 
302 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3634  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.08 
 
 
302 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0043574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4022  pseudouridine synthase, RluA family  47.42 
 
 
334 aa  280  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000767359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4031  ribosomal large subunit pseudouridine synthase  45.75 
 
 
302 aa  279  5e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00039208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0869  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  49.33 
 
 
306 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.73 
 
 
301 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  47.06 
 
 
304 aa  273  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  47.49 
 
 
305 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1813  pseudouridine synthase, RluA family  48.86 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3343  pseudouridine synthase, RluA family  44.94 
 
 
341 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0105982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  46.49 
 
 
323 aa  265  5.999999999999999e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.08 
 
 
296 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  51.68 
 
 
327 aa  265  7e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0908  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.25 
 
 
303 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00261324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0763  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.65 
 
 
305 aa  263  4e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  45.48 
 
 
305 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.41 
 
 
296 aa  261  1e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  46.2 
 
 
306 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.04 
 
 
304 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3536  ribosomal large subunit pseudouridine synthase RluD subfamily  44.48 
 
 
342 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.618363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  47.02 
 
 
316 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1985  RluA family pseudouridine synthase  41.91 
 
 
377 aa  259  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.122684  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  46.45 
 
 
326 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3086  pseudouridine synthase, RluA family  43.88 
 
 
341 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.226558 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.86 
 
 
308 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1651  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.75 
 
 
347 aa  259  6e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1598  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.75 
 
 
334 aa  258  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.8835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  45.87 
 
 
306 aa  258  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3146  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  46.18 
 
 
343 aa  258  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  44.59 
 
 
309 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1256  RluA family pseudouridine synthase  46.28 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1372  pseudouridine synthase, RluA family  44.26 
 
 
300 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1281  RluA family pseudouridine synthase  46.28 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.71357  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3196  RluA family pseudouridine synthase  45.39 
 
 
315 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2613  RluA family pseudouridine synthase  45.23 
 
 
343 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1237  RluA family pseudouridine synthase  45.82 
 
 
334 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289539  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  43.46 
 
 
304 aa  249  5e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0947  pseudouridine synthase, RluA family  43.62 
 
 
345 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.48756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1373  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  47.56 
 
 
312 aa  248  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2409  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.79 
 
 
349 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1072  RluA family pseudouridine synthase  43.79 
 
 
349 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0863187  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  43.14 
 
 
306 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.23 
 
 
343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2356  RluA family pseudouridine synthase  44.59 
 
 
313 aa  245  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  43.83 
 
 
315 aa  245  8e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  46.25 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2132  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.89 
 
 
332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.864009 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  44.98 
 
 
310 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0288  RluA family pseudouridine synthase  41.69 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  41.82 
 
 
344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0482  pseudouridine synthase, RluA family  44.94 
 
 
326 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.147798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  41.16 
 
 
314 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2164  RluA family pseudouridine synthase  41.81 
 
 
482 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.317837  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2903  RluA family pseudouridine synthase  44.3 
 
 
323 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413037  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2406  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  41.52 
 
 
335 aa  241  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0234677  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0061  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.86 
 
 
321 aa  240  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102185  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0606  pseudouridine synthase RluD  43.64 
 
 
391 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.32929  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  40.2 
 
 
305 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  44.27 
 
 
319 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2215  RluA family pseudouridine synthase  44.55 
 
 
341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.550248  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0984  pseudouridine synthase, RluA family  42.23 
 
 
320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0148654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  44.26 
 
 
320 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2118  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  42.02 
 
 
337 aa  239  5e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6759  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  43.67 
 
 
326 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0968  pseudouridine synthase, RluA family  42.26 
 
 
343 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.431214 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  42.02 
 
 
314 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0345  RluA family pseudouridine synthase  44.3 
 
 
351 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1005  RluA family pseudouridine synthase  41.96 
 
 
343 aa  235  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0372  pseudouridine synthase, RluA family  45.17 
 
 
334 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>