More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3799 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 
537 aa  1079    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0853  NADH dehydrogenase subunit L  41.84 
 
 
518 aa  336  7e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  37.5 
 
 
516 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  52.14 
 
 
510 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  41.75 
 
 
542 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4557  NADH dehydrogenase subunit L  36.15 
 
 
527 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.350402  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3485  NADH dehydrogenase subunit L  36.15 
 
 
527 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  41.75 
 
 
524 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5851  NADH dehydrogenase subunit L  37.05 
 
 
535 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  32.56 
 
 
526 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  33.11 
 
 
528 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.82 
 
 
546 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  34.6 
 
 
546 aa  209  9e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.99 
 
 
519 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.63 
 
 
516 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2333  NADH dehydrogenase (quinone)  39.88 
 
 
519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  37.5 
 
 
470 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  35.1 
 
 
524 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0320  NADH Dehydrogenase Protein  41.55 
 
 
523 aa  193  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1259  NADH dehydrogenase (quinone)  40.53 
 
 
519 aa  192  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0133  NADH dehydrogenase (quinone)  41.82 
 
 
1382 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4034  NADH dehydrogenase subunit L  44.94 
 
 
509 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190531  normal  0.750928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3404  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.18 
 
 
523 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5663  NADH dehydrogenase (quinone)  35.79 
 
 
519 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170475  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  45.72 
 
 
554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0212  NADH dehydrogenase (quinone)  33.26 
 
 
551 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0996  NADH/Ubiquinone/plastoquinone  33.52 
 
 
501 aa  166  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0930  NADH dehydrogenase (quinone)  31.34 
 
 
495 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0909  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.01 
 
 
559 aa  137  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  32.65 
 
 
685 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.04 
 
 
646 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  30.69 
 
 
706 aa  134  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  29.41 
 
 
662 aa  134  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2655  NADH dehydrogenase  31.89 
 
 
559 aa  133  9e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.4 
 
 
643 aa  133  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.33 
 
 
681 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1667  NADH dehydrogenase subunit L  29.72 
 
 
612 aa  133  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  30.63 
 
 
614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1993  NADH dehydrogenase subunit L  30.69 
 
 
715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351523  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.3 
 
 
666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  30.69 
 
 
711 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  27.88 
 
 
689 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  30.48 
 
 
636 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1189  NADH dehydrogenase subunit L  30.69 
 
 
720 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.495317  normal  0.332417 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0297  NADH dehydrogenase (quinone)  30.93 
 
 
494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00538088  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2527  NADH dehydrogenase subunit L  30.69 
 
 
720 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.96 
 
 
636 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2821  NADH dehydrogenase subunit L  30.56 
 
 
694 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0940629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.42 
 
 
704 aa  130  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.21 
 
 
642 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  30.85 
 
 
663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.86 
 
 
649 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.23 
 
 
770 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  32.13 
 
 
620 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0642  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  32.61 
 
 
770 aa  128  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1132  NADH dehydrogenase (quinone)  28 
 
 
529 aa  128  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  31.8 
 
 
651 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.87 
 
 
565 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4327  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.87 
 
 
565 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.824343  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.27 
 
 
639 aa  127  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  27.69 
 
 
643 aa  127  6e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  31.8 
 
 
652 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  30.22 
 
 
642 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  31.54 
 
 
768 aa  126  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  30.2 
 
 
661 aa  126  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.25 
 
 
758 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  30.14 
 
 
615 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3405  NADH dehydrogenase subunit L  33.8 
 
 
617 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  30.17 
 
 
661 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.42 
 
 
703 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  29.18 
 
 
653 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.16 
 
 
631 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.08 
 
 
667 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.98 
 
 
641 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4137  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.65 
 
 
701 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.768208  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  29.18 
 
 
653 aa  125  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  30.85 
 
 
613 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.42 
 
 
703 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0969  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.36 
 
 
759 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00014024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.18 
 
 
649 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.42 
 
 
705 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  26.72 
 
 
666 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.85 
 
 
667 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1609  NADH dehydrogenase subunit 5  32.65 
 
 
498 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46494  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  26.47 
 
 
666 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.42 
 
 
685 aa  124  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  29.02 
 
 
617 aa  124  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  29.02 
 
 
617 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2048  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.71 
 
 
702 aa  124  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475529  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  28.78 
 
 
654 aa  123  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4733  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.67 
 
 
689 aa  123  8e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0478983  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  29.89 
 
 
664 aa  123  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  28.9 
 
 
664 aa  123  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0850  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.54 
 
 
750 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  28.52 
 
 
621 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  29.79 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  31.85 
 
 
701 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  29.79 
 
 
613 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  31.37 
 
 
633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.26 
 
 
686 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>