More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0297 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0297  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
494 aa  958    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00538088  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0930  NADH dehydrogenase (quinone)  59.6 
 
 
495 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0298  putative transcriptional regulator, TetR family  55.67 
 
 
499 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0281  hypothetical protein  32.95 
 
 
506 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0276  hypothetical protein  32.95 
 
 
506 aa  211  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0084  NADH dehydrogenase subunit 5  36.15 
 
 
498 aa  158  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2938  NADH dehydrogenase subunit 5  34.11 
 
 
510 aa  151  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0909  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.05 
 
 
559 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  37.9 
 
 
524 aa  151  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2959  NADH dehydrogenase subunit 5  33.82 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.20551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3183  NADH dehydrogenase subunit 5  33.82 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3176  NADH dehydrogenase subunit 5  34.99 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3190  NADH dehydrogenase subunit 5  33.82 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2072  NADH dehydrogenase subunit 5  34.69 
 
 
510 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3198  NADH dehydrogenase subunit 5  33.82 
 
 
510 aa  146  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  34.53 
 
 
542 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0881  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.77 
 
 
560 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.369591  normal  0.953685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1992  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.06 
 
 
566 aa  144  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.620412  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2874  NADH dehydrogenase subunit 5  34.67 
 
 
510 aa  143  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.781902  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0487  NADH dehydrogenase subunit 5  36.46 
 
 
494 aa  143  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0474  NADH dehydrogenase subunit 5  36.46 
 
 
494 aa  143  8e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3191  NADH dehydrogenase subunit 5  34.37 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.538533  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  38.75 
 
 
565 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4327  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  39.11 
 
 
565 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.824343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2655  NADH dehydrogenase  36.52 
 
 
559 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1106  NADH dehydrogenase subunit 5  33.53 
 
 
510 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00149705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1609  NADH dehydrogenase subunit 5  33.88 
 
 
498 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  34.49 
 
 
524 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  34.74 
 
 
516 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2333  NADH dehydrogenase (quinone)  35.62 
 
 
519 aa  139  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194476  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  34.76 
 
 
516 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  37.5 
 
 
470 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.1 
 
 
546 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  32.78 
 
 
546 aa  136  8e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.22 
 
 
643 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  31.79 
 
 
621 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2476  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  45.75 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.84 
 
 
519 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
526 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3485  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.343885 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1132  NADH dehydrogenase (quinone)  32.33 
 
 
529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4557  NADH dehydrogenase subunit L  34.75 
 
 
527 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.350402  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  31.4 
 
 
689 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  32.99 
 
 
537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  36.27 
 
 
653 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
528 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.44 
 
 
675 aa  131  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  34.39 
 
 
719 aa  131  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  34.16 
 
 
670 aa  131  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  36.27 
 
 
653 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.52 
 
 
674 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0996  NADH/Ubiquinone/plastoquinone  38.41 
 
 
501 aa  130  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510949  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.86 
 
 
653 aa  130  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  33.44 
 
 
724 aa  129  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1324  NADH dehydrogenase subunit 5  35.58 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  35.49 
 
 
650 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  33.65 
 
 
686 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
686 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  32.69 
 
 
695 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.92 
 
 
671 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.52 
 
 
676 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  34.6 
 
 
654 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  33.23 
 
 
692 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  33.99 
 
 
662 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.16 
 
 
678 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  29.46 
 
 
614 aa  127  3e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.63 
 
 
649 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.45 
 
 
672 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.6 
 
 
660 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1259  NADH dehydrogenase (quinone)  33.57 
 
 
519 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0320  NADH Dehydrogenase Protein  37.83 
 
 
523 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  35.14 
 
 
636 aa  127  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  30.59 
 
 
621 aa  127  6e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.78 
 
 
652 aa  126  7e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.62 
 
 
659 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.42 
 
 
636 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.01 
 
 
666 aa  126  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.74 
 
 
639 aa  126  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  35.23 
 
 
656 aa  126  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  33.01 
 
 
686 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  32.56 
 
 
661 aa  126  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2825  NADH-quinone oxidoreductase chain L  33.57 
 
 
657 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2694  NADH-quinone oxidoreductase chain L  33.57 
 
 
657 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  34.78 
 
 
642 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  31.06 
 
 
687 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  34.51 
 
 
633 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2684  NADH dehydrogenase subunit L  35.61 
 
 
648 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  32.54 
 
 
654 aa  125  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4034  NADH dehydrogenase subunit L  36.6 
 
 
509 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.190531  normal  0.750928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3404  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.09 
 
 
523 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.92 
 
 
671 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  33.45 
 
 
678 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.63 
 
 
686 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  32.62 
 
 
768 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  31.9 
 
 
688 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  33.44 
 
 
664 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  35.74 
 
 
510 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.96 
 
 
681 aa  124  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  33.33 
 
 
682 aa  124  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  31.9 
 
 
701 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>