More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1609 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1609  NADH dehydrogenase subunit 5  100 
 
 
498 aa  982    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2072  NADH dehydrogenase subunit 5  49.29 
 
 
510 aa  475  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3198  NADH dehydrogenase subunit 5  50.41 
 
 
510 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3191  NADH dehydrogenase subunit 5  48.28 
 
 
510 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.538533  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2874  NADH dehydrogenase subunit 5  49.18 
 
 
510 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.781902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3176  NADH dehydrogenase subunit 5  48.89 
 
 
510 aa  463  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3190  NADH dehydrogenase subunit 5  49.38 
 
 
510 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2959  NADH dehydrogenase subunit 5  49.38 
 
 
510 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.20551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2938  NADH dehydrogenase subunit 5  49.18 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3183  NADH dehydrogenase subunit 5  49.38 
 
 
510 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1106  NADH dehydrogenase subunit 5  51.16 
 
 
510 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00149705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1324  NADH dehydrogenase subunit 5  52.05 
 
 
500 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0084  NADH dehydrogenase subunit 5  43.9 
 
 
498 aa  408  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0487  NADH dehydrogenase subunit 5  44.99 
 
 
494 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0474  NADH dehydrogenase subunit 5  44.99 
 
 
494 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0751  NADH dehydrogenase subunit 5  35.1 
 
 
505 aa  220  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0281  hypothetical protein  37.5 
 
 
506 aa  164  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0276  hypothetical protein  37.5 
 
 
506 aa  163  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0298  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 
499 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2651  putative NADH dehydrogenase  33.45 
 
 
542 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387844  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0909  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.61 
 
 
559 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1132  NADH dehydrogenase (quinone)  26.19 
 
 
529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0297  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
494 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00538088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2655  NADH dehydrogenase  32.87 
 
 
559 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2889  NADH dehydrogenase (quinone)  30.27 
 
 
524 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1380  putative NADH dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 
524 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.95 
 
 
686 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4321  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.33 
 
 
565 aa  124  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4327  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.33 
 
 
565 aa  124  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.824343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  32.89 
 
 
642 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.93 
 
 
685 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0881  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.6 
 
 
560 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.369591  normal  0.953685 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1992  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.29 
 
 
566 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.620412  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0930  NADH dehydrogenase (quinone)  42.37 
 
 
495 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2019  NADH dehydrogenase subunit L  35.14 
 
 
510 aa  117  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202632  normal  0.0936538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2476  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  37.32 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1184  NADH dehydrogenase subunit L  32.92 
 
 
516 aa  117  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.43 
 
 
652 aa  117  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0832  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.86 
 
 
516 aa  116  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3799  NADH dehydrogenase subunit L  32.65 
 
 
537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383274  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.34 
 
 
628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3854  NADH dehydrogenase (quinone)  30.96 
 
 
528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000586232  unclonable  0.000014067 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0480  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.55 
 
 
639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1153  NADH dehydrogenase I chain L  30.19 
 
 
669 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.72 
 
 
654 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  27.51 
 
 
662 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0566  NADH dehydrogenase (quinone)  31.19 
 
 
526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.28147  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3218  NADH dehydrogenase subunit L  31.19 
 
 
642 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136607  normal  0.0162367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00908  NADH dehydrogenase  32.97 
 
 
470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0559164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1359  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.16 
 
 
546 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  29.47 
 
 
642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.32 
 
 
678 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1662  NADH dehydrogenase, putative  32.01 
 
 
546 aa  110  5e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.6 
 
 
671 aa  110  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  31.67 
 
 
695 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0853  NADH dehydrogenase subunit L  38.41 
 
 
518 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.55 
 
 
650 aa  110  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.6 
 
 
672 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2705  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.66 
 
 
659 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.32 
 
 
671 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  28.72 
 
 
633 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.11 
 
 
627 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.6 
 
 
676 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  28.86 
 
 
650 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01298  NADH dehydrogenase subunit L  30.67 
 
 
719 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0550  NADH dehydrogenase subunit L  28.33 
 
 
636 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.297459  normal  0.844264 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5064  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.42 
 
 
649 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  30.71 
 
 
692 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  31.32 
 
 
692 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3179  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.27 
 
 
625 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  29.47 
 
 
675 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  29.92 
 
 
634 aa  108  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  28.97 
 
 
620 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  29.1 
 
 
644 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0653  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.23 
 
 
519 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  28.62 
 
 
667 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.97 
 
 
653 aa  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  30.36 
 
 
695 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1606  NADH dehydrogenase (ubiquinone), L subunit  30.9 
 
 
653 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0557  NADH-quinone oxidoreductase chain L  30.9 
 
 
653 aa  107  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4054  NADH dehydrogenase subunit L  31.54 
 
 
652 aa  107  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.431336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2820  NADH dehydrogenase subunit L  30.48 
 
 
724 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586459  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  27.18 
 
 
614 aa  107  6e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  30.6 
 
 
670 aa  107  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  36.03 
 
 
554 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.605013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.82 
 
 
679 aa  106  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  30.28 
 
 
682 aa  106  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  30.63 
 
 
679 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  30.63 
 
 
679 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  30.63 
 
 
679 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1998  NADH dehydrogenase subunit L  32.04 
 
 
689 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.304901 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  30.63 
 
 
679 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  30.63 
 
 
679 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  30.63 
 
 
679 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  31.43 
 
 
675 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.03 
 
 
618 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.25 
 
 
678 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  30.07 
 
 
654 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  30.63 
 
 
679 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  30.87 
 
 
651 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>