More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1110 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
618 aa  1200    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.96 
 
 
662 aa  633  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  56.88 
 
 
657 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  54.97 
 
 
613 aa  591  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.25 
 
 
618 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  52.41 
 
 
614 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  52.41 
 
 
614 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  52.27 
 
 
617 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  52.25 
 
 
614 aa  555  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  50.81 
 
 
613 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  50.41 
 
 
613 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  50.41 
 
 
613 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  53.37 
 
 
616 aa  551  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  50.57 
 
 
613 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  50.99 
 
 
611 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  50.41 
 
 
613 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  52.85 
 
 
615 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  50.57 
 
 
613 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.41 
 
 
613 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  53.67 
 
 
615 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  50.99 
 
 
611 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  49.92 
 
 
611 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  49.59 
 
 
613 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  49.59 
 
 
613 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  49.59 
 
 
613 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  50.16 
 
 
611 aa  542  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  52.34 
 
 
616 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  50 
 
 
613 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  53.02 
 
 
617 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  52.69 
 
 
617 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  52.1 
 
 
616 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  52.1 
 
 
617 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  52.27 
 
 
617 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  52.93 
 
 
617 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  52.46 
 
 
615 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  53.99 
 
 
615 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  52.56 
 
 
617 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  53.82 
 
 
615 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  53.02 
 
 
615 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  49.11 
 
 
624 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  49.27 
 
 
624 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  52.33 
 
 
625 aa  503  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  55.05 
 
 
616 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  49.18 
 
 
624 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.41 
 
 
622 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.65 
 
 
630 aa  472  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.41 
 
 
621 aa  457  1e-127  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  41.77 
 
 
636 aa  458  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.8 
 
 
617 aa  449  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.13 
 
 
634 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.63 
 
 
667 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.69 
 
 
642 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.84 
 
 
667 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40 
 
 
667 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.79 
 
 
639 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.61 
 
 
668 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.1 
 
 
627 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.87 
 
 
628 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.43 
 
 
642 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  39.7 
 
 
666 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.15 
 
 
669 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.7 
 
 
662 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.47 
 
 
710 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.14 
 
 
623 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.06 
 
 
676 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.96 
 
 
639 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.96 
 
 
639 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.96 
 
 
639 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.37 
 
 
683 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  46.28 
 
 
624 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.29 
 
 
642 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.14 
 
 
666 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  42.63 
 
 
642 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.63 
 
 
650 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.88 
 
 
652 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.76 
 
 
660 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  39.76 
 
 
654 aa  375  1e-102  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  42.33 
 
 
688 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  41.81 
 
 
683 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.56 
 
 
654 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  43.4 
 
 
697 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.56 
 
 
637 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  37.85 
 
 
614 aa  370  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  42.23 
 
 
688 aa  372  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.51 
 
 
654 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  42.19 
 
 
701 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  37 
 
 
692 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.57 
 
 
656 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0278  NADH dehydrogenase subunit L  41.88 
 
 
634 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  36.66 
 
 
713 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  36.83 
 
 
695 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1160  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.74 
 
 
671 aa  366  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.42 
 
 
641 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0413  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.11 
 
 
676 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0151  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.22 
 
 
623 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.31 
 
 
678 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  42.36 
 
 
697 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  38.6 
 
 
685 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.03 
 
 
674 aa  369  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  42.41 
 
 
670 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>