More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3122 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  59.74 
 
 		 613 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  59.74 
 
 		 613 aa  680    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  62.6 
 
 		 617 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  62.64 
 
 		 615 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  62.5 
 
 		 617 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  60.3 
 
 		 613 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  59.77 
 
 		 611 aa  679    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  62.27 
 
 		 617 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  60.76 
 
 		 616 aa  643    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  59.74 
 
 		 613 aa  681    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  62.44 
 
 		 617 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  60.13 
 
 		 613 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  61.54 
 
 		 616 aa  641    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  60.2 
 
 		 611 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  59.77 
 
 		 611 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  60.3 
 
 		 613 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  61.79 
 
 		 617 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  64.03 
 
 		 615 aa  681    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  59.74 
 
 		 613 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  59.9 
 
 		 613 aa  682    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  60.17 
 
 		 611 aa  686    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  60.33 
 
 		 615 aa  646    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  59.74 
 
 		 613 aa  681    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  60.77 
 
 		 614 aa  662    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  60.3 
 
 		 613 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 		 617 aa  1194    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  59.9 
 
 		 613 aa  682    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  60.13 
 
 		 616 aa  650    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  60.94 
 
 		 614 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  62.44 
 
 		 617 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  62.15 
 
 		 615 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  64.03 
 
 		 615 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  62.44 
 
 		 617 aa  697    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  63.95 
 
 		 616 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  60.94 
 
 		 614 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  60.75 
 
 		 615 aa  616  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  58.13 
 
 		 624 aa  613  9.999999999999999e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  57.97 
 
 		 624 aa  609  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  56.52 
 
 		 624 aa  605  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  52.36 
 
 		 613 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.8 
 
 		 618 aa  512  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50 
 
 		 621 aa  508  9.999999999999999e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.38 
 
 		 618 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.61 
 
 		 662 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  50.15 
 
 		 657 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.26 
 
 		 622 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.51 
 
 		 667 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.18 
 
 		 667 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.97 
 
 		 667 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.89 
 
 		 642 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.24 
 
 		 628 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.52 
 
 		 625 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.76 
 
 		 630 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  39.4 
 
 		 636 aa  402  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.11 
 
 		 634 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  41.88 
 
 		 701 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  41.46 
 
 		 688 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.72 
 
 		 637 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  40.31 
 
 		 643 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.25 
 
 		 683 aa  389  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.51 
 
 		 668 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.62 
 
 		 639 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  40.54 
 
 		 697 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.52 
 
 		 642 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  41.77 
 
 		 697 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  41.03 
 
 		 666 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.28 
 
 		 643 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.19 
 
 		 641 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0932  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.03 
 
 		 642 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.27 
 
 		 669 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  40.79 
 
 		 683 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.46 
 
 		 627 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  41.25 
 
 		 688 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.76 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.96 
 
 		 646 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.61 
 
 		 676 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  38.6 
 
 		 654 aa  373  1e-102  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  39.38 
 
 		 650 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  39.45 
 
 		 664 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.91 
 
 		 639 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.91 
 
 		 639 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.91 
 
 		 639 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  41.1 
 
 		 695 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.73 
 
 		 681 aa  372  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  36.65 
 
 		 682 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  38.51 
 
 		 685 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  38.67 
 
 		 663 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.09 
 
 		 650 aa  371  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.56 
 
 		 652 aa  372  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  47.32 
 
 		 689 aa  371  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.46 
 
 		 653 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.16 
 
 		 666 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0280  NADH dehydrogenase subunit L  35.85 
 
 		 713 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346221  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.78 
 
 		 686 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.53 
 
 		 705 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  37 
 
 		 692 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.39 
 
 		 710 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  36.61 
 
 		 706 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0251  NADH dehydrogenase subunit L  35.85 
 
 		 713 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.6 
 
 		 678 aa  365  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>