More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7008 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  59.81 
 
 
639 aa  700    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
634 aa  1274    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  59.87 
 
 
630 aa  709    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.26 
 
 
642 aa  688    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  56.37 
 
 
636 aa  689    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  53.02 
 
 
627 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50 
 
 
667 aa  595  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.01 
 
 
667 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.63 
 
 
667 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.02 
 
 
628 aa  533  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.74 
 
 
668 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  48.04 
 
 
666 aa  525  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47 
 
 
710 aa  527  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  47.97 
 
 
669 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.08 
 
 
642 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.65 
 
 
662 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.18 
 
 
676 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  44.16 
 
 
661 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1928  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.7 
 
 
801 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289204  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  44.09 
 
 
664 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  43.14 
 
 
662 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  43.77 
 
 
661 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  43.03 
 
 
663 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  43.18 
 
 
664 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.4 
 
 
639 aa  473  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  42.22 
 
 
654 aa  466  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.85 
 
 
625 aa  464  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  44.26 
 
 
688 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.26 
 
 
676 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0441  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.26 
 
 
676 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.592794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.62 
 
 
683 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  43.25 
 
 
666 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.85 
 
 
642 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  43.35 
 
 
643 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1298  NADH dehydrogenase subunit L  43.62 
 
 
681 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9729  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4156  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.2 
 
 
676 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  43.4 
 
 
666 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.52 
 
 
641 aa  458  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.89 
 
 
650 aa  458  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0413  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.59 
 
 
676 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2289  NADH dehydrogenase subunit L  40.14 
 
 
689 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  43.15 
 
 
614 aa  453  1.0000000000000001e-126  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  44.67 
 
 
701 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.12 
 
 
643 aa  453  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.92 
 
 
637 aa  452  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  42.02 
 
 
650 aa  452  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0192  NADH dehydrogenase subunit L  42.05 
 
 
610 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.69 
 
 
651 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  43.47 
 
 
697 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1203  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.58 
 
 
703 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.52 
 
 
666 aa  445  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.85 
 
 
639 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.85 
 
 
639 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.85 
 
 
639 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.75 
 
 
705 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  0.222128 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  43.55 
 
 
697 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  43.04 
 
 
620 aa  442  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1074  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.44 
 
 
703 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.26 
 
 
636 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.22 
 
 
621 aa  439  1e-121  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  44.74 
 
 
642 aa  438  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.97 
 
 
675 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  41.12 
 
 
685 aa  435  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4401  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.06 
 
 
704 aa  435  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.908035 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  43.15 
 
 
620 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  43.3 
 
 
620 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.23 
 
 
666 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  44.12 
 
 
688 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.97 
 
 
681 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.74 
 
 
646 aa  435  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  43.18 
 
 
644 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.03 
 
 
654 aa  433  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  42.58 
 
 
667 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  43.5 
 
 
683 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.13 
 
 
618 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.14 
 
 
653 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  42.02 
 
 
613 aa  430  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  43.34 
 
 
620 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.2 
 
 
691 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.59 
 
 
631 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0293  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  42.19 
 
 
669 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  43.17 
 
 
669 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1272  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.62 
 
 
608 aa  432  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  42.04 
 
 
654 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.89 
 
 
660 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  41.7 
 
 
692 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2233  NADH dehydrogenase subunit L  40.6 
 
 
703 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  40.75 
 
 
695 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  40.94 
 
 
686 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.46 
 
 
649 aa  426  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  43.15 
 
 
620 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  38.32 
 
 
682 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1515  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  41.26 
 
 
668 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  40.94 
 
 
695 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  40.17 
 
 
696 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5217  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  41.43 
 
 
693 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.25 
 
 
652 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  43.74 
 
 
662 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  41.99 
 
 
651 aa  428  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03270  NADH dehydrogenase subunit L  43.46 
 
 
632 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>