More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2557 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  94.68 
 
 		 613 aa  1155    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  94.84 
 
 		 613 aa  1157    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  69.22 
 
 		 617 aa  817    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  81.89 
 
 		 616 aa  977    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  57.72 
 
 		 624 aa  635    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  71.19 
 
 		 615 aa  796    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  68.94 
 
 		 617 aa  796    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  85.84 
 
 		 615 aa  978    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  78.32 
 
 		 614 aa  934    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  78.49 
 
 		 614 aa  934    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  69.38 
 
 		 617 aa  798    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  58.62 
 
 		 624 aa  650    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  94.84 
 
 		 613 aa  1154    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  94.68 
 
 		 613 aa  1155    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  69.22 
 
 		 617 aa  799    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  69.13 
 
 		 617 aa  783    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  67.97 
 
 		 616 aa  751    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  82.28 
 
 		 615 aa  983    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  94.82 
 
 		 611 aa  1152    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  69.05 
 
 		 617 aa  796    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  94.84 
 
 		 613 aa  1156    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  94.68 
 
 		 613 aa  1155    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 613 aa  1218    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  81.32 
 
 		 616 aa  939    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  78.32 
 
 		 614 aa  934    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  99.84 
 
 		 611 aa  1214    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  99.51 
 
 		 611 aa  1211    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  69.38 
 
 		 615 aa  788    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 613 aa  1218    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  94.99 
 
 		 611 aa  1154    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  58.13 
 
 		 624 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.3 
 
 		 621 aa  704    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  82.34 
 
 		 616 aa  985    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  68.72 
 
 		 617 aa  793    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  70.05 
 
 		 615 aa  806    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  95.01 
 
 		 613 aa  1159    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  69.88 
 
 		 615 aa  804    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 613 aa  1218    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  94.18 
 
 		 613 aa  1148    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.33 
 
 		 617 aa  612  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.11 
 
 		 618 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  51.96 
 
 		 613 aa  551  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.36 
 
 		 618 aa  534  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  48.91 
 
 		 657 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.24 
 
 		 662 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.76 
 
 		 622 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.43 
 
 		 625 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41 
 
 		 630 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.63 
 
 		 634 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.97 
 
 		 642 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.3 
 
 		 639 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41 
 
 		 667 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.18 
 
 		 628 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  37.46 
 
 		 636 aa  388  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.79 
 
 		 667 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.2 
 
 		 667 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  44.1 
 
 		 624 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.74 
 
 		 683 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.59 
 
 		 646 aa  373  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.04 
 
 		 637 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.81 
 
 		 627 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  40.27 
 
 		 666 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.96 
 
 		 669 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  40.77 
 
 		 688 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.79 
 
 		 678 aa  362  8e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.67 
 
 		 676 aa  362  9e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.9 
 
 		 639 aa  362  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.9 
 
 		 639 aa  362  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.9 
 
 		 639 aa  362  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  38.48 
 
 		 692 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.9 
 
 		 710 aa  361  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.26 
 
 		 681 aa  361  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  38.49 
 
 		 695 aa  360  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.88 
 
 		 668 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  39.06 
 
 		 670 aa  360  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.09 
 
 		 674 aa  359  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  40.18 
 
 		 701 aa  359  9e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.13 
 
 		 642 aa  359  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.95 
 
 		 654 aa  359  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  38.54 
 
 		 684 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.66 
 
 		 654 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  38.29 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  38.09 
 
 		 654 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.87 
 
 		 679 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.8 
 
 		 660 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.2 
 
 		 758 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0751  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  45.25 
 
 		 768 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  38.41 
 
 		 684 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  38.41 
 
 		 684 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  38.41 
 
 		 684 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  38.28 
 
 		 664 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0168  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  42.05 
 
 		 625 aa  357  5e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  37.64 
 
 		 684 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  38.26 
 
 		 679 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  38.41 
 
 		 684 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  38.24 
 
 		 684 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  38.26 
 
 		 679 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  38.26 
 
 		 679 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  38.26 
 
 		 679 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  38.26 
 
 		 679 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>