More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3384 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  91.44 
 
 
654 aa  1193    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  58.62 
 
 
642 aa  701    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
654 aa  1290    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.38 
 
 
683 aa  564  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.03 
 
 
634 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.93 
 
 
628 aa  433  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  39.07 
 
 
636 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.67 
 
 
630 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.87 
 
 
667 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.12 
 
 
667 aa  415  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.66 
 
 
627 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.26 
 
 
667 aa  414  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.92 
 
 
642 aa  412  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.06 
 
 
637 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.51 
 
 
668 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4547  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.95 
 
 
631 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.35 
 
 
710 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  40 
 
 
666 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.8 
 
 
662 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0920  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.32 
 
 
639 aa  392  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  42.42 
 
 
613 aa  389  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.93 
 
 
642 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.97 
 
 
646 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  38.24 
 
 
654 aa  389  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.7 
 
 
618 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.18 
 
 
625 aa  383  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  39.05 
 
 
664 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  42.12 
 
 
701 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  41.39 
 
 
688 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  39.49 
 
 
669 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  38.89 
 
 
654 aa  380  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.89 
 
 
660 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  36.56 
 
 
614 aa  377  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.82 
 
 
641 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.33 
 
 
639 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  42.01 
 
 
697 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  38.73 
 
 
662 aa  379  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  40.54 
 
 
666 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1754  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.82 
 
 
656 aa  378  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4492  NADH dehydrogenase subunit L  41.19 
 
 
638 aa  372  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.655452  normal  0.47705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.79 
 
 
725 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.540916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  42.05 
 
 
697 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4407  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.85 
 
 
636 aa  375  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  41.03 
 
 
688 aa  375  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  40.36 
 
 
663 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0554  NADH dehydrogenase I, L subunit  36.99 
 
 
621 aa  375  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.445121  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  39.31 
 
 
664 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.67 
 
 
643 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0292  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  41.83 
 
 
642 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  40 
 
 
666 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  38.28 
 
 
661 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1928  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.3 
 
 
801 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289204  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.55 
 
 
676 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  38.13 
 
 
661 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1536  NADH dehydrogenase subunit L  42.81 
 
 
626 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2209  NADH dehydrogenase subunit L  39.9 
 
 
683 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.56 
 
 
618 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.94 
 
 
656 aa  369  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4156  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.47 
 
 
676 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322847 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.63 
 
 
639 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.63 
 
 
639 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.63 
 
 
639 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1160  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.37 
 
 
671 aa  364  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13177  NADH dehydrogenase subunit L  40.4 
 
 
633 aa  365  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0476  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  37.06 
 
 
621 aa  364  3e-99  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0461902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4452  NADH dehydrogenase subunit L  39.88 
 
 
651 aa  364  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.221921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1566  NADH dehydrogenase subunit L  41.96 
 
 
642 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.08621  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1590  NADH dehydrogenase subunit L  41.96 
 
 
642 aa  363  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.03 
 
 
645 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.1 
 
 
624 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.9 
 
 
726 aa  362  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.11 
 
 
668 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2684  NADH dehydrogenase subunit L  41.09 
 
 
648 aa  360  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0441  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.64 
 
 
676 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.592794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.35 
 
 
676 aa  360  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  39.2 
 
 
611 aa  359  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6671  NADH dehydrogenase subunit L  41.83 
 
 
644 aa  359  9e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.421809  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1515  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  37.82 
 
 
668 aa  359  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  39.24 
 
 
611 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6083  NADH dehydrogenase subunit L  41.3 
 
 
662 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0681759 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.24 
 
 
613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  39.24 
 
 
613 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  39.24 
 
 
611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.74 
 
 
651 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  38.74 
 
 
643 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  36.34 
 
 
650 aa  357  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  38.98 
 
 
620 aa  357  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.19 
 
 
653 aa  357  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  39.08 
 
 
613 aa  356  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  39.08 
 
 
613 aa  356  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  39.08 
 
 
613 aa  356  8.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0391  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.59 
 
 
649 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  38.43 
 
 
614 aa  355  1e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  40.7 
 
 
695 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  39.08 
 
 
613 aa  356  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  39.08 
 
 
613 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  40.06 
 
 
620 aa  355  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  39.27 
 
 
611 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07490  NADH dehydrogenase subunit L  38.17 
 
 
641 aa  355  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0146936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  38.43 
 
 
614 aa  355  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>