More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2997 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.45 
 
 
733 aa  768    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0459554 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4988  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  56.57 
 
 
736 aa  744    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  100 
 
 
725 aa  1454    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.540916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2096  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  89.94 
 
 
726 aa  1310    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1746  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.39 
 
 
696 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.275907  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit L  39.32 
 
 
695 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.949191  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1977  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  43.57 
 
 
665 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5217  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  42.07 
 
 
693 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.08 
 
 
651 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.98 
 
 
691 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.74 
 
 
645 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.062647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0660  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.87 
 
 
687 aa  433  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0293  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.37 
 
 
669 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.27 
 
 
642 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02211  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.42 
 
 
668 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.292389  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4024  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.93 
 
 
693 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.03 
 
 
691 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.697145  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01641  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.97 
 
 
667 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.124159  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26701  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.37 
 
 
670 aa  422  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.28 
 
 
642 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2400  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  38.36 
 
 
669 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1515  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  39.1 
 
 
668 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.06 
 
 
624 aa  407  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.69 
 
 
683 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.69 
 
 
642 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.25 
 
 
628 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0151  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  36.86 
 
 
673 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01681  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  37 
 
 
673 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.35 
 
 
675 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.67 
 
 
710 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1627  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.22 
 
 
656 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01661  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  36.99 
 
 
670 aa  395  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  40.73 
 
 
686 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1269  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.61 
 
 
819 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2579  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.96 
 
 
823 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.08345  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01771  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  36.81 
 
 
678 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.473718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  40.61 
 
 
695 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  36.51 
 
 
636 aa  389  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  34.36 
 
 
823 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.862723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.04 
 
 
634 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  41.09 
 
 
654 aa  383  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.36 
 
 
667 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.3 
 
 
654 aa  385  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  36.88 
 
 
667 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  40.48 
 
 
686 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.1 
 
 
627 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.29 
 
 
630 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  39.87 
 
 
682 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.81 
 
 
678 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.09 
 
 
660 aa  382  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.26 
 
 
667 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  40.65 
 
 
692 aa  382  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.06 
 
 
642 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  38.09 
 
 
620 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  39.74 
 
 
679 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.09 
 
 
654 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  39.74 
 
 
679 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  39.74 
 
 
679 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  39.9 
 
 
679 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.16 
 
 
650 aa  377  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  39.74 
 
 
679 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  39.9 
 
 
679 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.04 
 
 
650 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  39.74 
 
 
679 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  40.38 
 
 
686 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.02 
 
 
639 aa  376  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40 
 
 
682 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0852  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.23 
 
 
770 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.826241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  42.21 
 
 
663 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.63 
 
 
671 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.72 
 
 
670 aa  375  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  39.45 
 
 
692 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  48.12 
 
 
670 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_002936  DET0931  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  40.25 
 
 
654 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  39.6 
 
 
684 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.54 
 
 
654 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_802  NADH:quinone oxidoreductase subunit 5 (chain L)  40.1 
 
 
654 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1039  NADH dehydrogenase subunit L  39.37 
 
 
684 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.726828  normal  0.66397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5566  NADH dehydrogenase subunit L  39.77 
 
 
684 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.541263  normal  0.19343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.03 
 
 
662 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  40.06 
 
 
695 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  39.77 
 
 
684 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  39.77 
 
 
684 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  39.6 
 
 
684 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  39.77 
 
 
684 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  38.57 
 
 
620 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  41.19 
 
 
666 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  38.72 
 
 
664 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  38.57 
 
 
620 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  38.12 
 
 
620 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1865  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.25 
 
 
758 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.13806  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.1 
 
 
675 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1289  F420H2 dehydrogenase subunit L  39.6 
 
 
665 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000132103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.27 
 
 
676 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  41.24 
 
 
666 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.83 
 
 
666 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.07 
 
 
637 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5417  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
620 aa  365  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
620 aa  365  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5468  NADH dehydrogenase subunit L  38.27 
 
 
620 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>