More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1464 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02203  NADH dehydrogenase subunit L  79.47 
 
 		 613 aa  958    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.705855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1379  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  79.47 
 
 		 613 aa  957    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.285953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1736  NADH dehydrogenase subunit L  69.6 
 
 		 617 aa  813    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235558  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4129  NADH dehydrogenase subunit L  69.44 
 
 		 617 aa  832    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2432  NADH dehydrogenase subunit L  79.24 
 
 		 611 aa  950    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1011  NADH dehydrogenase subunit L  72.4 
 
 		 615 aa  813    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3375  NADH dehydrogenase I, L subunit  68.94 
 
 		 617 aa  809    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.762716  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2427  NADH dehydrogenase subunit L  79.47 
 
 		 613 aa  957    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1570  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 614 aa  1219    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2502  NADH dehydrogenase subunit L  78.15 
 
 		 613 aa  947    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3207  NADH dehydrogenase subunit L  69.1 
 
 		 617 aa  811    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000541221  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0594  NADH dehydrogenase subunit L  59.26 
 
 		 624 aa  659    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0869223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2654  NADH dehydrogenase subunit L  78.97 
 
 		 613 aa  952    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3417  NADH dehydrogenase subunit L  79.4 
 
 		 611 aa  952    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2559  NADH dehydrogenase subunit L  71.26 
 
 		 615 aa  823    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2762  NADH dehydrogenase subunit L  83.28 
 
 		 615 aa  985    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2540  NADH dehydrogenase subunit L  81.73 
 
 		 616 aa  958    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3613  NADH dehydrogenase subunit L  68.02 
 
 		 617 aa  788    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.703817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2822  NADH dehydrogenase subunit L  78.15 
 
 		 613 aa  950    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2571  NADH dehydrogenase subunit L  79.47 
 
 		 613 aa  959    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2422  NADH dehydrogenase subunit L  70.62 
 
 		 616 aa  786    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.886749  normal  0.161461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3701  NADH dehydrogenase subunit L  69.1 
 
 		 617 aa  805    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1806  NADH dehydrogenase subunit L  99.67 
 
 		 614 aa  1217    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02163  hypothetical protein  79.47 
 
 		 613 aa  958    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.560332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1404  NADH dehydrogenase subunit L  82.15 
 
 		 616 aa  938    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.212624  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1689  NADH dehydrogenase subunit L  58.36 
 
 		 624 aa  651    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1502  NADH dehydrogenase subunit L  82.84 
 
 		 616 aa  984    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2457  NADH dehydrogenase subunit L  78.07 
 
 		 611 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2557  NADH dehydrogenase subunit L  78.15 
 
 		 613 aa  947    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0583  NADH dehydrogenase subunit L  58.84 
 
 		 624 aa  655    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0371  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  61.49 
 
 		 621 aa  705    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2664  NADH dehydrogenase subunit L  78.15 
 
 		 613 aa  947    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2546  NADH dehydrogenase subunit L  78.24 
 
 		 611 aa  944    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1374  NADH dehydrogenase subunit L  79.47 
 
 		 613 aa  958    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3298  NADH dehydrogenase subunit L  85.49 
 
 		 615 aa  967    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.982229  normal  0.619241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29880  NADH dehydrogenase subunit L  71.1 
 
 		 615 aa  821    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.019108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28540  NADH dehydrogenase subunit L  70.03 
 
 		 615 aa  794    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.314589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1464  NADH dehydrogenase subunit L  100 
 
 		 614 aa  1219    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1863  NADH dehydrogenase subunit L  69.44 
 
 		 617 aa  808    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.141943 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3122  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  60.78 
 
 		 617 aa  595  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1349  NADH dehydrogenase I, L subunit  53.1 
 
 		 613 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3815  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.12 
 
 		 618 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1110  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  51.93 
 
 		 618 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.970459  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1023  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  50.7 
 
 		 662 aa  542  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116112  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1117  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  50.7 
 
 		 657 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.752039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0708  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.72 
 
 		 625 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2870  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.43 
 
 		 622 aa  459  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0441123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.8 
 
 		 630 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.94 
 
 		 634 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.62 
 
 		 667 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  39.06 
 
 		 636 aa  403  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.25 
 
 		 642 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.6 
 
 		 667 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.85 
 
 		 667 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3431  NADH dehydrogenase I, L subunit  44.65 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.5 
 
 		 642 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.39 
 
 		 683 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  40.21 
 
 		 666 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.46 
 
 		 639 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  40.56 
 
 		 669 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.5 
 
 		 628 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.31 
 
 		 710 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.78 
 
 		 676 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.34 
 
 		 637 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.99 
 
 		 627 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  41.01 
 
 		 654 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.01 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  40.81 
 
 		 661 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  39.7 
 
 		 650 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.97 
 
 		 668 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.31 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0168  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  44.91 
 
 		 625 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3339  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.14 
 
 		 646 aa  366  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584461  normal  0.81981 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  40.98 
 
 		 661 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  45.13 
 
 		 670 aa  364  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  40.35 
 
 		 701 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  39.93 
 
 		 692 aa  362  8e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.49 
 
 		 623 aa  362  9e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.54 
 
 		 671 aa  362  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  38.08 
 
 		 643 aa  361  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3384  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.58 
 
 		 654 aa  361  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.31001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  41.2 
 
 		 686 aa  361  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0151  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.92 
 
 		 623 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1213  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.43 
 
 		 642 aa  359  7e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.78 
 
 		 639 aa  359  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.78 
 
 		 639 aa  359  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.78 
 
 		 639 aa  359  8e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  39.91 
 
 		 642 aa  359  9e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2415  NADH dehydrogenase subunit L  41.48 
 
 		 688 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0841593  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_002978  WD0967  NADH dehydrogenase I, L subunit  39.49 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.597239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  39.42 
 
 		 664 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  37.44 
 
 		 672 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.36 
 
 		 666 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.57 
 
 		 662 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.59 
 
 		 674 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  45.6 
 
 		 695 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.87 
 
 		 678 aa  357  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  38.33 
 
 		 643 aa  357  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.77 
 
 		 653 aa  357  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  41.09 
 
 		 686 aa  356  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>