More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3344 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3999  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  78.03 
 
 
667 aa  1058    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000018763 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0349  NADH dehydrogenase I, L subunit  88.51 
 
 
666 aa  1113    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3915  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  77.73 
 
 
667 aa  1056    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3344  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  100 
 
 
669 aa  1343    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299069  normal  0.337139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3127  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  76.53 
 
 
667 aa  1053    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4233  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  85.8 
 
 
668 aa  1082    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000128592  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4071  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.92 
 
 
630 aa  587  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0380631  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1294  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.66 
 
 
710 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5944  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.35 
 
 
642 aa  577  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1371  NADH dehydrogenase I chain L  48.43 
 
 
636 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0995158  normal  0.863733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7008  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  48.12 
 
 
634 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102171  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1305  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.5 
 
 
676 aa  553  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.674922  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3898  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49 
 
 
639 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1235  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.94 
 
 
627 aa  546  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1533  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.09 
 
 
628 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1657  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  49.24 
 
 
642 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.735121  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3624  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.77 
 
 
637 aa  527  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0473906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1247  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  47.37 
 
 
662 aa  523  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123872  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1566  NADH dehydrogenase subunit L  44.64 
 
 
643 aa  514  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1727  NADH dehydrogenase subunit L  44.4 
 
 
663 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1102  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.33 
 
 
650 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0808  NADH dehydrogenase subunit L  44.56 
 
 
661 aa  502  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0813  NADH dehydrogenase subunit L  44.61 
 
 
661 aa  500  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1272  NADH dehydrogenase subunit L  43.83 
 
 
666 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.288124  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0901  NADH dehydrogenase subunit L  43.48 
 
 
664 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44664  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1364  NADH dehydrogenase subunit L  43.4 
 
 
666 aa  496  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.703678  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1504  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43 
 
 
671 aa  497  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0410124  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2554  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  43.58 
 
 
650 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.62 
 
 
676 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.78 
 
 
681 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1959  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.01 
 
 
653 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0502995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0441  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  46.32 
 
 
676 aa  485  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.592794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3499  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.58 
 
 
676 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4622  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.62 
 
 
641 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.58 
 
 
678 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211408  normal  0.708243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1535  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit F  43.16 
 
 
691 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2412  NADH dehydrogenase subunit L  42.9 
 
 
664 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33518  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2802  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.27 
 
 
673 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.377628 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.97 
 
 
675 aa  485  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5169  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.27 
 
 
679 aa  483  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1327  NADH dehydrogenase subunit L  43.43 
 
 
685 aa  480  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0169357 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0789  NADH dehydrogenase subunit L  42.86 
 
 
654 aa  482  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0323982  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1040  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.63 
 
 
685 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2585  NADH dehydrogenase subunit L  44.28 
 
 
701 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274397  normal  0.410839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1194  NADH dehydrogenase subunit L  41.84 
 
 
711 aa  481  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3203  NADH dehydrogenase subunit L  40.2 
 
 
692 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161285  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0883  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.68 
 
 
671 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1033  NADH dehydrogenase subunit L  42.55 
 
 
662 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0726  NADH dehydrogenase subunit L  41.16 
 
 
679 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608468  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2051  NADH dehydrogenase subunit L  41.06 
 
 
686 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1310  NADH dehydrogenase subunit L  41.12 
 
 
679 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1818  NADH dehydrogenase subunit L  41.16 
 
 
679 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.179044  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1446  NADH dehydrogenase subunit L  41.12 
 
 
679 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0374  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.7 
 
 
625 aa  476  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1301  NADH dehydrogenase subunit L  41.12 
 
 
679 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1141  NADH dehydrogenase subunit L  41.16 
 
 
679 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.237098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1354  NADH dehydrogenase subunit L  40.6 
 
 
695 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0117862  normal  0.0417376 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0424  NADH dehydrogenase subunit L  41.16 
 
 
679 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.523849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0968  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.44 
 
 
672 aa  477  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.159681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1274  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.13 
 
 
678 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.202313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3215  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.62 
 
 
643 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937058  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5537  NADH dehydrogenase subunit L  43.95 
 
 
620 aa  475  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0906168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0960  NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5  39.75 
 
 
682 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.476185  normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0985  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.13 
 
 
624 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1072  NADH dehydrogenase subunit L  41.08 
 
 
682 aa  475  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0413  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  45.87 
 
 
676 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1928  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  43.74 
 
 
801 aa  475  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289204  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2050  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.15 
 
 
670 aa  472  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3287  NADH dehydrogenase subunit L  45.33 
 
 
697 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33354  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0938  NADH dehydrogenase subunit L  40.44 
 
 
692 aa  474  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3743  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.54 
 
 
651 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0639  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.27 
 
 
639 aa  475  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1634  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.27 
 
 
639 aa  475  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3182  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.27 
 
 
639 aa  475  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4156  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  44.96 
 
 
676 aa  472  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0322847 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2246  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.32 
 
 
660 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1414  NADH dehydrogenase (quinone)  41.21 
 
 
670 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0499245 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0832  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.85 
 
 
686 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2203  NADH dehydrogenase subunit L  40.81 
 
 
686 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.786286  normal  0.908285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0972  NADH dehydrogenase subunit L  40.35 
 
 
695 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.65171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4550  NADH dehydrogenase subunit L  44.91 
 
 
695 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0852267  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2619  NADH-quinone oxidoreductase, L subunit  40.32 
 
 
654 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1435  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.74 
 
 
674 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.353757  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1880  NADH dehydrogenase subunit L  41.04 
 
 
686 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.835925  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2874  NADH dehydrogenase subunit L  44.79 
 
 
697 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429312  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2387  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.05 
 
 
666 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00790686  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1512  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  40.76 
 
 
666 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00433523 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5142  NADH dehydrogenase subunit L  44.54 
 
 
620 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4974  NADH dehydrogenase subunit L  44.54 
 
 
620 aa  465  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4992  NADH dehydrogenase subunit L  44.25 
 
 
620 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5383  NADH dehydrogenase subunit L  44.1 
 
 
620 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.0362e-16 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1038  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  42.9 
 
 
642 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2155  NADH dehydrogenase subunit L  40.78 
 
 
684 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.511007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0758  NADH dehydrogenase subunit L  41.04 
 
 
706 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1626  NADH dehydrogenase subunit L  40.78 
 
 
684 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1953  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain L  41.79 
 
 
652 aa  465  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.146282  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2276  NADH dehydrogenase subunit L  40.78 
 
 
684 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2238  NADH dehydrogenase subunit L  40.78 
 
 
684 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2262  NADH dehydrogenase subunit L  40.78 
 
 
684 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.231302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1876  NADH dehydrogenase subunit L  43.03 
 
 
688 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>